КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ

Номер 14-15-00619

НазваниеИзучение биологического разнообразия вирусов животных - потенциальных возбудителей социально значимых заболеваний человека.

РуководительЛукашев Александр Николаевич, Доктор медицинских наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное автономное научное учреждение «Федеральный научный центр исследований и разработки иммунобиологических препаратов им. М.П.Чумакова РАН» (Институт полиомиелита), г Москва

Период выполнения при поддержке РНФ 2014 г. - 2016 г.  , продлен на 2017 - 2018. Карточка проекта продления (ссылка)

Конкурс№1 - Конкурс 2014 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами».

Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины, 05-403 - Медицинская микробиология и вирусология

Ключевые словавирус, возникающие заболевания, зооноз, межвидовая передача, гепатит

Код ГРНТИ34.25.39

СтатусУспешно завершен

 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ

Аннотация
За последние 100 лет отмечено возникновение (как совершенно новых инфекций либо как глобальных медицинских проблем) порядка 20 новых опасных и особо опасных инфекций человека, в том числе ВИЧ, ряд геморрагических лихорадок, хантавирусный респираторный дистресс-синдром, атипичная пневмония, высокопатогенные варианты гриппа и т.д. В подавляющем большинстве случаев эти вирусы были переданы человеку от животных. В каждом случае их появление сопровождалось значительными социально-экономическими последствиями. После возникновения в 2002-2003 гг. эпидемии атипичной пневмонии (SARS), передающейся воздушно-капельным путем и сопровождавшейся смертностью порядка 10%, возникло понимание полной неадекватности существовавших систем эпидемиологического надзора в случае появления нового вируса. Как следствие, в последние годы во всем мире велось активное изучение вирусов животных, принадлежащих к родам, включающим известные возбудители социально значимых заболеваний. Были открыты сотни новых вирусов и значительно расширены знания о закономерностях эволюции вирусов и потенциале возникновения новых вирусных инфекций человека. В РФ такие работы практически не выполнялись, а данные, полученные в других странах, не в полной мере могут быть экстраполированы на РФ из-за их привязки к диким животным. В рамках данной работы предполагается изучить на территории РФ биологическое разнообразие вирусов животных (в первую очередь, грызунов), родственных социально значимым вирусам человека, в первую очередь вирусу гепатита С, вирусу гепатита Е, хантавирусам, энтеровирусам - возбудителям гепатита, геморрагических лихорадок, энцефалита. В результате работы будут получены новые знания о разнообразии вирусов животных (в первую очередь грызунов и летучих мышей) – потенциальных возбудителей новых инфекций человека на территории РФ, об эволюции вирусов человека и животных, истории возникновения ряда существующих вирусов человека. Будет сформулирован прогноз возможности возникновения таких инфекций в разных регионах РФ, радикально улучшены существующие в стране возможности для детекции и идентификации возникающих вирусов. Будут созданы банки биологических образцов человека и животных для дальнейшего развития данной отрасли исследований.

Ожидаемые результаты
В результате выполнения проекта предполагается получить данные о распространении и биологическом разнообразии на территории РФ вирусов животных - потенциальных возбудителей социально значимых заболеваний человека, в частности, гепатит С - подобных вирусов, гепатит Е - подобных вирусов, хантавирусов, энтеровирусов, пикорнавирусов. Первые подобные работы были выполнены в других странах мира в 2008-2013 гг, и хотя в результате этих работ общие представления о механизмах возникновения новых вирусов были значительно уточнены, целостная картина глобальной экологии потенциальных возникающих вирусов далека от совершенства. Полученные в результате выполнения работы результаты позволят сократить отставание РФ в данной области и существенно дополнят мировые данные об экологии изученных вирусов, поскольку в исследовании будут использованы биологические образцы, собранные в разных регионах РФ и не доступные для изучения ведущими мировыми группами. В результате работы будут существенно улучшены доступные методики выявления неизвестных вирусов, необходимые для обеспечения биологической безопасности в случае возникновения новых вирусных инфекций. Результаты работы будут опубликованы в научных статьях в зарубежных журналах.

 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ

Аннотация результатов, полученных в 2014 году
Проведен сбор полевого материала и первичный скрининг образцов, собранных от рыжей полевки, кроликов, летучих мышей, комаров и клещей на наличие новых вирусов из семейств Hepaciviridae, Hepeviridae, Picornaviridae, Phleboviridae. Исследование положительных проб продолжается. Открыт новый пикорна-подобный вирус с необычной структурой генома, предположительно представляющий новое семейство. Завершено описание вируса Адлер - нового хантавируса, способного вызвать заболевание человека. При помощи молекулярно-генетических методов изучена история возникновения вируса везикулярной болезни свиней 2 типа, вызвавшего эпизоотию в Тамбове в 1975 г.

 

Публикации

1. Мутных Е.С., Бернштейн А.Д., Калинкина Е.В., Дзагурова Т.К., Коротина Н.А., Толстова Г.А., Тихонова Г.Д., Ткаченко Е.А. Геморрагическая лихорадка с почечным синдромом в Тамбовской области Эпидемиология и Вакцинопрофилактика, №5(78) стр. 40-48 (год публикации - 2014)

2. Ткаченко Е.А., Витковски П.Т., Радоза Л., Дзагурова Т.К., Окулова Н.М., Юничева Ю.В., Василенко Л., Морозов В.Г., Малкин Г.А., Крюгер Д.Х., Клемпа Б. Adler hantavirus, a new genetic variant of Tula virus identified in Major's pine voles (Microtus majori) sampled in southern European Russia Infection, genetics and evolution, 29C:156-163 (год публикации - 2014) https://doi.org/PMID: 25433134

Аннотация результатов, полученных в 2015 году
Были проведены исследования биологического разнообразия для ряда вирусов. В рамках международного консорциума изучены характеристики структурных регуляторных элементов, вирусных белков, особенностей кодирования генетической информации у вирусов грызунов, летучих мышей и ежей, сходных с вирусом гепатита А. Описано заимствование некоторыми гепатит А подобными вирусами некодирующих структурных элементов генома у гепатит С - подобных вирусов. Сравнение области генома 2А этих вирусов показало, что они не гомологичны, т.е. произошли в результате заимствования вирусом генетической информации из неизвестных источников. Расследована история возникновения вируса везикулярной болезни свиней 2 типа в СССР в 1975 году. Первый серотип вируса известен во всем мире и произошел от человеческого вируса Коксаки В5 приблизительно в 1960 г. Мы показали, что эпизоотия везикулярной болезни свиней в ССР в 1975 г. была вызвана вирусом, который произошел в 1945-1975 г. от другого человеческого вируса, Коксаки В4. По неизвестной причине вирус 1 типа стал возбудителем глобальной эпизоотии, а заболеваемость 2 типом самопроизвольно исчезла. Таким образом, показан большой потенциал энтеровирусов человека как источников опасных патогенов животных. Расследована первая в РФ вспышка менингоэнцефалита, вызванного энтеровирусом 71 типа, которая произошла в Ростове-на-Дону в 2013 г. Установлено, что вирус-возбудитель был внесен на территорию РФ и СНГ из Китая за 3 года до вспышки и циркулировал во многих регионах страны, не вызывая клинически регистрируемой заболеваемости. Во время вспышки вирус был занесен в Ставрополь, где также не было официально зарегистрировано заболеваемости. Таким образом, можно предполагать, что генетическая характеристика штамма не является ведущим фактором при возникновении вспышек заболевания. Охарактеризован обнаруженный ранее в РФ новый хантавирус Адлер, способный вызывать геморрагическую лихорадку с почечным синдромом.

 

Публикации

1. Corman VM, Grundhoff A, Baechlein C, Fischer N, Gmyl A, Wollny R, Dei D, Ritz D, Binger T, Adankwah E, Marfo KS, Annison L, Annan A, Adu-Sarkodie Y, Oppong S, Becher P, Drosten C, Drexler JF Highly Divergent Hepaciviruses from African Cattle Journal of Virology, 89(11):5876-82 (год публикации - 2015) https://doi.org/10.1128/JVI.00393-15

2. Drexler JF, Corman VM, Lukashev AN, van den Brand JM, Gmyl AP, Brünink S, Rasche A, Seggewiβ N, Feng H, Leijten LM, Vallo P, Kuiken T, Dotzauer A, Ulrich RG, Lemon SM, Drosten C Evolutionary origins of hepatitis A virus in small mammals Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA, pii: 201516992 (год публикации - 2015)

3. Ахмадишина Л.В., Говорухина М.В., Ковалев Е.В., Ненадская С.А., Иванова О.Е., Лукашев А.Н. Enterovirus A71 Meningoencephalitis Outbreak, Rostov-on-Don, Russia, 2013 Emerging Infectious Diseases, 21(8):1440-3 (год публикации - 2015) https://doi.org/10.3201/eid2108.141084

4. Крюгер Д.Х., Ткаченко Е.А., Морозов В.Г., Юничева Ю.В., Плинкова О.М., Малкин Г, Ишмухаметов А.А., Гайнеман П, Витковски П.Т., Клемпа Б., Дзагурова Т.К. Life-Threatening Sochi Virus Infections, Russia. Emerging Infectious Diseases, 21(12):2204-8 (год публикации - 2015) https://doi.org/10.3201/eid2112.150891

5. Ломакина Н.Ф., Шустова Е.Ю., Стрижакова О.М., Дрекслер Я.Ф., Лукашев А.Н. Epizootic of vesicular disease in pigs caused by coxsackievirus B4 in the Soviet Union in 1975 Journal of General Virology, 97(1):49-52 (год публикации - 2015) https://doi.org/10.1099/jgv.0.000318

Аннотация результатов, полученных в 2016 году
В 2016 г. была продолжена работа по изучению вирусов животных - потенциальных возбудителей заболеваний человека. Была завершена разработка тест-системы для выявления в насекомых всех возможных флебовирусов. В настоящее время известен ряд флебовирусов - возбудителей лихорадочных заболеваний человека. При помощи разработанной тест-системы в клещах, собранных в Астраханской области, удалось обнаружить 8 новых флебовирусов. Продолжаются исследования по сравнению генетического разнообразия новых и известных флебовирусов. Также была изучена филогенетическая история и филогеография вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки. Показано, что занос вируса на территорию РФ произошел всего 100-300 лет назад, предположительно из Средней Азии через Астрахань. Затем вирус распространился в Турцию и на Балканы. Таким образом, показано, что ККГЛ фактически являлась возникающим заболеванием в РФ и Европе. Кроме того, проводились работы по совершенствованию методов молекулярной диагностики возникающих инфекций человека.

 

Публикации

1. Дедков В.Г., Лукашев А.Н., Девяткин А.А. и соавт. Retrospective diagnosis of two rabies cases in humans by high throughput sequencing Journal of Clinical Virology, 78:74-81 (год публикации - 2016) https://doi.org/10.1016/j.jcv.2016.03.012

2. Климентов А.С., Бутенко А.М., Хуторецкая Н.В., Шустова Е.Ю., Ларичев В.Ф., Исаева О.В., Карганова Г.Г., Лукашев А.Н., Гмыль А.П. Development of pan-phlebovirus RT-PCR assay Journal of Virological Methods, 232:29-32 (год публикации - 2016) https://doi.org/10.1016/j.jviromet.2016.02.009

3. Лукашев А.Н., Климентов А.С., Смирнова С.Е., Дзагурова Т.К., Дрекслер Я.Ф., Гмыль А.П. Phylogeography of Crimean Congo Hemorrhagic Fever Virus PLOS One, 11(11): e0166744 (год публикации - 2016) https://doi.org/10.1371/journal.pone.0166744

Возможность практического использования результатов
не указано