КАРТОЧКА
ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер 16-16-04108
НазваниеРазработка иммунодиагностических систем для комплексного контроля пораженности семенного картофеля бактериальными, вирусными и вироидными инфекциями
РуководительСафенкова Ирина Викторовна, Кандидат биологических наук
Организация финансирования, регион Федеральное государственное учреждение "Федеральный исследовательский центр "Фундаментальные основы биотехнологии" Российской академии наук", г Москва
Период выполнения при поддержке РНФ | 2016 г. - 2018 г. | , продлен на 2019 - 2020. Карточка проекта продления (ссылка) |
Конкурс№16 - Конкурс 2016 года на получение грантов по приоритетному направлению деятельности РНФ «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований по поручениям (указаниям) Президента Российской Федерации» (исследования в области картофелеводства и птицеводства).
Область знания, основной код классификатора 06 - Сельскохозяйственные науки, 06-104 - Агробиотехнологии
Ключевые словаФитопатогены, семенной картофель, вирусные инфекции, бактериальные инфекции, вироиды, иммунодиагностика, экспресс-тесты, пробоподготовка, высокочувствительный иммуноанализ, амплификация сигнала, мультипараметрический анализ
Код ГРНТИ68.35.49
СтатусУспешно завершен
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
Целью проекта является разработка и характеристика эффективной системы комплексного скрининга посевного картофеля, обеспечивающей высокопроизводительный мультипараметрический контроль основных фитопатогенов вирусной, вироидной и бактериальной природы.
Актуальность данной разработки определяется значительными потерями отечественного сельского хозяйства, обусловленными болезнями картофеля. Данный фактор приводит к снижению урожайности на 10-25%, а при эпифитотиях – до 80%. Учитывая возможность быстрого распространения инфекции в полевых условиях (например, для возбудителей, передаваемых насекомыми), крайне важно предельно минимизировать долю пораженных растений в посевном материале. С учетом распространенности, контагиозности и негативных последствий заражения выделяют десять приоритетных для картофелеводства в России патогенов, которые должны контролироваться в посевном материале. Существующие на сегодняшний день аналитические методы характеризуются трудоемкостью, методической сложностью, необходимостью значительных расходов как на реагенты, так и на приборное обеспечение. В связи с этим крайне востребовано создание новых методов, позволяющих проводить высокопроизводительное тестирование, одновременно и с высокой чувствительностью контролируя наличие в посевном картофеле всех основных фитопатогенов. Реализация такого аналитического метода обеспечит его конкурентный потенциал, возможность широкого практического применения и, благодаря этому – значительное повышение урожайности при выращивании картофеля.
Научная новизна разработки основывается на сочетании при контроле фитопатогенов принципа иммунохроматографического анализа и оригинальных дополнительных методических решений, направленных на существенное повышение чувствительности и производительности тестирования.
Метод иммунохроматографии обеспечивает экспрессность проведения анализа при минимальной пробоподготовке, отсутствии дополнительных реагентов и манипуляций с предподготовленным тестом, простоту детектирования результатов анализа. Все реагенты, необходимые для формирования детектируемых комплексов, предварительно наносятся на мембранные компоненты тест-полоски, контакт которой с тестируемой пробой (растертом в соответствующем растворе биоматериале – пробах листьев, клубня или стебля картофеля) инициирует движение жидкости вдоль тест-полоски под действием капиллярных сил. В ходе этого движения происходят специфические иммунные взаимодействия с потенциально содержащимся в пробе фитопатогеном, приводящие к формированию на определенных участках тест-полоски комплексов, содержащих иммунореагенты и окрашенную метку, наличие которой (отражающее наличие в пробе патогена) может контролироваться визуально, а интенсивность окрашивания (отражающая его содержание) - с помощью автономных портативных фотометрических детекторов, включая оптику бытовых коммуникационных устройств.
Высокая чувствительность иммунохроматографического анализа в предлагаемых системах (обеспечивающая снижение предела обнаружения на один-два порядка) будет достигаться благодаря использованию предложенных авторами проекта оригинальных методических решений, включающих амплификацию сигнала а) при последовательном аффинном связывании нескольких нанодисперсных маркеров либо б) при независимой регистрации множественных вторичных маркеров, вымываемых из комплекса иммунореагентов с первичным маркером, в) разделение повторяющихся детерминант – компонентов вирусных и бактериальных антигенов – с их последующей независимой иммунодетекцией и др. На скрининговой стадии обследований для одновременного контроля большого числа фитопатогенов будут использоваться конъюгаты нанодисперсных окрашенных маркеров со смешанными препаратами антител разной специфичности, а на стадии подтверждающего тестирования – принцип двумерной иммунохроматографии, предполагающий формирование на тест-полоске упорядоченного массива зон связывания с иммунореагентами разной специфичности. Кроме того, для эффективного практического применения разрабатываемых тест-систем будут реализованы ранее предложенные заявителями подходы (успешно апробированные во внедренных в практику иммунохроматографических тестах для контроля других соединений), обеспечивающие воспроизводимость результатов анализа, высокую стабильность тест-систем при хранении.
Исследования, которые планируется провести в 2016-2018 гг., должны будут обеспечить обоснованный выбор наиболее эффективных методических решений для анализа фитопатогенов картофеля, определить требования к компонентам тест-систем и протоколам их получения, а также к режимам проведения тестирования (включая порядок проведения высокопроизводительного неавтоматизированного тестирования большого количества проб). Будет охарактеризована аффинность и специфичность имеющихся у заявителей и коммерчески доступных антител для детекции приоритетных патогенов картофеля, сопоставлены аналитические возможности различных маркеров, используемых в иммунохроматографии. Особое внимание будет уделено получению реагентов для специфической иммунодетекции вироида веретеновидности клубней картофеля, который в силу отсутствия белковой оболочки не может быть использован как иммуноген в стандартных схемах иммунизации. Закономерности формирования специфических иммунных комплексов, их состав и реакционная способность будут изучаться с использованием комплекса современных методов, включающих просвечивающую электронную микроскопию, различные варианты атомно-силовой микроскопии, высокоразрешающую просвечивающую электронную микроскопию и сканирующую электронную микроскопию, биосенсорную регистрацию аффинных взаимодействий на основании измерений поверхностного плазмонного резонанса. Установленные в ходе этих исследований количественные закономерности позволят не только аргументированно выбрать оптимальные комплектации тест-систем и протоколы проведения анализа, но и предложить универсальные алгоритмы характеристики иммунореагентов, применимые для других иммуноаналитических систем (как при расширении панели контролируемых фитопатогенов, так и при решении других диагностических задач в медицине, ветеринарии, контроле потребительской продукции, экологическом мониторинге).
Выбор технологических решений, наиболее эффективных при последующем серийном производстве тест-систем, будет производиться с учетом имеющегося у заявителей опыта по созданию и внедрению в практику средств иммунодиагностики. В состав исполнителей проекта входят авторы более чем 40 статей в международных журналах по разработке и характеристике иммунохроматографических тест-систем, лауреат Премии Правительства РФ 2010 года в области науки и техники за создание и внедрение в отечественную практику новых биотехнологических методов анализа. Экспериментальные серии тест-систем будут изготавливаться с использованием полупромышленного и промышленного оборудования, обеспечивающего унификацию процедур нанесения иммунореагентов на носители и их стабилизации, а также формировании тест-полосок. Характеристика предлагаемых технологических решений будет проводиться с учетом оценки их реализации малым предприятием, основанным организацией-заявителем и специализирующимся в области производства средств иммунодиагностики. Такой непосредственный учет практических требований в рамках проекта позволит оперативно перейти к технологизации и коммерциализации его результатов.
Для доказательной проверки диагностической эффективности разрабатываемых тест-систем проект будет выполняться с привлечением специалистов из ВНИИ картофельного хозяйства им. А.Г. Лорха, имеющих многолетний опыт мониторинга заболеваний картофеля с использованием различных аналитических методов, а также располагающих полевой базой и контактами для формирования широких репрезентативных выборок, необходимых для доказательных испытаний и сравнительной характеристики разрабатываемых тестов. Проект будет включать апробацию создаваемых тест-систем с использованием панелей проб из разных регионов РФ, что также повысит информативность и практическую значимость результатов проводимых испытаний.
Ожидаемые результаты
В рамках проекта будут разработаны диагностические системы, основанные на принципе иммунохроматографического анализа, для одновременной диагностики ключевых экономически значимых бактериальных, вирусных и вироидных патогенов картофеля. Комплектация тест-систем будет обеспечивать возможность контроля всех приоритетных фитопатогенов при контроле семенного картофеля фитопатогенов в соответствии с действующими в РФ нормативными требованиями, а именно: бактерий – возбудителей черной ножки и кольцевой гнили, вироида веретеновидности клубней картофеля, вируса скручивания листьев картофеля, X-, Y-, M- и S-вирусов картофеля. При этом реализуемые в создаваемых тест-системах принципы мультиплексного анализа позволяют изменять комплектацию тестов, исходя из развития эпифитологической ситуации, расширения или замен в панели контролируемых фитопатогенов.
Тест-системы должны иметь следующие аналитические характеристики, определяющие конкурентные перспективы их широкого практического применения:
- экспрессность (продолжительность тестирования, включая этапы пробоподготовки и усиления аналитического сигнала, – не более 30 минут),
- низкие пределы детекции (≤ 10(4) кл./мл – для бактерий, ≤ 10 нг/мл – для вирусов, ≤ 10 нг/мл – для вироида),
- минимальная трудоемкость (отсутствие необходимости в использовании дополнительных реагентов и устройств при проведении анализа; контакт пробы с тест-полоской инициирует все последующие процессы);
- возможность высокопроизводительного скрининга (унифицированные протоколы пробоподготовки и тестирования, позволяющие характеризовать до 40 проб в час);
- высокая достоверность диагностики (чувствительность и достоверность детекции фитопатогенов на репрезентативных выборках – не ниже 92%).
Тест-системы будет реализованы в двух вариантах – для скринингового и подтверждающего тестирования. В первом варианте результатом анализа будет информация о присутствии в пробе хотя бы одного контролируемого фитопатогена, во втором – его идентификация.
Для подтверждения соответствия разработки мировому уровню и конкурентоспособности по сравнению с другими применяемыми в современной практике тест-системами в рамках проекта будет проведено сравнение аналитических характеристик разработанных тест-систем и коммерчески доступных иммунохроматографических тестов производства фирм «Loewe», «Bioreba» и др. (перечень будет уточняться с учетом ассортимента на момент окончания проекта), ориентированных, в отличие от предлагаемой разработки, на монопараметрическое тестирование.
В рамках проекта будет проведена сравнительная характеристика различных методических решений, направленных на снижение предела обнаружения в иммунохроматографии. Критерием успешности данных работ будет выбор нового подхода, обеспечивающего достоверное снижение минимальных определяемых концентраций бактериальных и вирусных патогенов не менее чем в 10 раз по сравнению с традиционными форматами проведения иммунохроматографического анализа. По результатам разработок планируется подача заявки на патент РФ.
Практическая значимость разработки обеспечивается созданием и детальной характеристикой экспериментальных образцов тест-систем, обеспечивающих полный скрининг контролируемых приоритетных патогенов семенного картофеля, и адаптацией разработки к имеющимся решениям по масштабированию производства, в том числе на базе фирм – партнеров заявителя. Благодаря решению в рамках проекта вопросов воспроизводимости результатов анализа, стабильности тест-систем, выбору их комплектации с учетом технических и экономических требований серийного производства будет сокращен временной интервал до внедрения тест-систем в практику.
Планируемые способы обнародования результатов, полученных в ходе выполнения проекта, включают:
• подготовку и публикацию научных статей по вопросам разработки и характеристики новых иммуноаналитических систем: не менее 8 статей – в изданиях, индексируемых в базах данных «Сеть науки» (Web of Science) или «Скопус» (Scopus), плюс дополнительно не менее 2 статей в российских журналах, индексируемых в базе данных РИНЦ (заявители планируют публикацию не менее 4 статей по результатам проекта в журналах, соответствующих первой либо второй квартилям по импакт-факторам, устанавливаемым в базе данных «Сеть науки» (Web of Science) для соответствующих областей научных разработок, что рассматривается как дополнительное требование к качеству разработок и как средство более широкого информирования научного сообщества о полученных результатах):
• представление результатов исследований на профильных научных мероприятиях;
• регистрацию интеллектуальной собственности на новые методические решения, связанные с методиками получения реагентов для иммуноанализа и/или способами иммунодетекции, – подача заявки на патент на изобретение либо полезную модель;
• рассмотрение с потенциальными производителями тест-систем планов организации серийного производства;
• подготовку и распространение информационных материалов для потенциальных конечных пользователей тест-систем;
• проведение в 2018 г. на территории Российской Федерации очной конференции с участием не менее 10 сельскохозяйственных предприятий и представлением на ней результатов разработок.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Аннотация результатов, полученных в 2016 году
Главной задачей в рамках трехлетнего проекта является разработка тест-систем, основанных на принципе иммунохроматографического анализа, для эффективного скрининга ключевых бактериальных, вирусных и вироидных патогенов картофеля: возбудители черной ножки и кольцевой гнили, вирус скручивания листьев картофеля, X-, Y-, M- и S-вирусы картофеля, вироид веретеновидности клубней картофеля в семенном материале картофеля.
Проект основан на новых методических решениях, направленных на снижение времени анализа, предела обнаружения для фитопатогенов, включающих бактериальные, вирусные и вироидную инфекции, а также решений, позволяющих проводить комплексный анализа 10 фитопатогенов в одной пробе. Реализация подходов, предложенных в настоящем проекте, обеспечит высокий конкурентный потенциал тест-системы, возможность широкого практического применения и, благодаря этому – значительное повышение урожайности при выращивании картофеля.
Работы по проекту, выполненные в 2016 г., были направлены на проведение сравнительной характеристики аффинности и специфичности иммунореагентов для иммунодетекции девяти приоритетных фитопатогенов, а также на получение конъюгатов наночастиц для специфического распознавания фитопатогенов и для амплификации сигнала в разрабатываемых системах.
Отдельный блок работ был проведен по получению вироида веретеновидности клубней картофеля, для которого будут впервые получены специфические иммунореагенты и разработана иммуноаналитическая тест-система. На данном этапе осуществлена наработка вироида в препаративных количествах и характеристика чистоты полученного препарата. С помощью обратной транскрипции вироидной кДНК и полимеразной цепной реакции получено 1,3 мг РНК-транскрипта. УФ-спектрофотометрический анализ и электрофорез в агарозном геле подтвердили, что полученная РНК соответствует линейной форме вироидной РНК. Разработаны протоколы химической модификации вироидной РНК для последующей иммунизации и получения специфических антител.
Все препараты антител, были охарактеризованы и сопоставлены по аффинности и специфичности. В работе использовали поликлональные и моноклональные антител. Константы взаимодействия, полученные на основании измерений поверхностного плазмонного резонанса в биосенсорной системе, для всех антител находились в диапазоне от 3.5×10(4) до 2.2×10(5) 1/Ms для кинетической константы ассоциации, от 3.7×10(-4) до 9.8×10(-4) 1/s для кинетической константы диссоциации, от 1×10(-8) до 4×10(-9) M для равновесной константы диссоциации. Таким образом, все антитела являются высокоаффинными, что обеспечит низкий предел обнаружения наряду с использованием уникальных схем усиления сигнала в иммуноанализе. Для оценки специфичности иммунореагентов и предотвращения рисков ложноположительных результатов диагностики было проведено тестирование с использованием коллекций штаммов, насчитывающих 17 изолятов, принадлежащих девяти различным бактериальным патогенам (близкородственные патогены и патогены, принадлежащих другим таксономическим группам). Проведена оценка перекрестных реакций с сапрофитными бактериями и с экстрактами здоровых растений. Тестирование проводили в форматах традиционного твердофазного прямого (с использованием модифицированных производных антител) и конкурентного иммуноферментного анализа в равновесных условиях, а также визуализировали иммунные комплексы, образуемые с вирусными и бактериальными патогенами, с использованием микроскопических техник (атомно-силовая микроскопия, просвечивающая электронная микроскопия). Высокую специфичность выбранных антител подтверждали специфические титры, более чем в 200 раз превышающие неспецифические, и низкие фоновые значения неспецифических реакций при использовании антител в иммуноферментных системах. Эффективность антител, полученных для детекции Dickeya sp., подтверждена реализацией с их использованием монопараметрической тест-системы для диагностики черной ножки картофеля, вызываемой D. dianthicola and D. solani. Для данной системы установлены следующие характеристики: визуальный предел обнаружения в листьях - 1 × 10(5) КОЕ/мл, в клубнях - 4 × 10(5) КОЕ/мл, время анализа - 10 мин. Данные по селективности антител, специфичных к D. dianthicola и D. solani вошли в состав статьи (Safenkova et al. «Development of a lateral flow immunoassay for rapid diagnosis of potato blackleg caused by Dickeya species»), принятой к публикации в журнал Analytical and Bioanalytical Chemistry (doi: 10.1007/s00216-016-0140-6).
С целью последующего использования в разрабатываемых иммуноаналитических системах выбранные препараты антител были модифицированы, что включало их биотинилирование и введение линкерных структур с концевыми амино- или карбоксигруппами, получение Fab фрагментов. Конъюгаты антител с коллоидным золотом (КЗ) и магнитными наночастицами (МНЧ) были получены тремя способами: методом физико-химической адсорбции биомолекул на поверхности наночастиц; методом ковалентной направленной иммобилизации биомолекул на поверхности наночастиц; методом нековалентной направленной иммобилизации биомолекул на поверхности коллоидного золота с использованием пары биотин-стрептавидин. Получены серии конъюгатов КЗ с антителами (моноспецифичный конъюгат), с биотинилированными антителами (моноспецифичный конъюгат с возможностью амплификации), с несколькими антителами (мультиспецифичный конъюгат), со стрептавидином (конъюгат для направленной иммобилизации биотинилированных антител), с белком А (конъюгат для направленной иммобилизации не биотинилированных антител). Характеристика наночастиц и их конъюгатов проводилась с использованием комплекса методов, включающих электронную и атомно-силовую микроскопию, регистрацию динамического светорассеяния, благодаря чему получены достоверные данные о размерах, сорбционной емкости и микрогетерогенности носителей-маркеров. Для наночастиц КЗ, обладающих меньшими размерами (3 препарата со средними диаметрами 15, 24 и 35 нм), отмечена большая гомогенность и наночастиц, и конъюгатов с антителами, полученными на их основе (СV ≤15%). Для препаратов на основе МНЧ с гидродинамический диаметром 566 ± 174 нм и индекс полидисперсности – 0,148 наблюдалась большая гетерогенность. Для синтезированных конъюгатов с МНЧ с антителами гидродинамический диаметр составил 615±134 нм, индекс полидисперсности – 0,078; конъюгатов МНЧ с биотинилированными антителами – 626 ± 105 нм, индекс полидисперсности – 0,074; конъюгатов МНЧ со стрептавидин – пероксидазой – 671 ± 147 нм, индекс полидисперсности – 0,088. Для всех синтезированных препаратов показана высокая стабильность и сохранение оптических (по результатам спектрофотометрического анализа) и антиген-связывающих свойств (по результатам иммуноферментного и иммунохроматографического сравнения) после длительного хранения (от 1 до 12 недель).
Таким образом, сформирован пул реагентов для специфического распознавания фитопатогенов и для амплификации сигнала в аналитических зонах разрабатываемых тест-систем. Проведенная экспериментальная характеристика полученных реагентов подтвердила возможность их применения в иммунохроматографическом анализе.
Параллельно с работами по характеристике иммунореагентов была сформирована панель биопроб для лабораторной характеристики прототипных тест-систем. Пораженность вирусными фитопатогенами биопроб, полученных из растений-накопителей (картофель, томат, табак), специально зараженных очищенными препаратами вирусов, была подтверждена в 100% случаев методом ИФА. Показано, что каждая биопроба содержит один вид вирусного фитопатогена, смешанные инфекции не были обнаружены. Экстракты, полученные из партий семенного картофеля (двадцать семь объединенных партий семенного картофеля из различных регионов Российской Федерации) предварительно тестировали методом полимеразной цепной реакции в реальном времени и ИФА. В результате показано присутствие бактериальных патогенов (C. michiganensis subsp. sepedonicus, P. atrosepticum, Dickeya species) в части биопроб. Данные по содержанию в пробах Dickeya species будут опубликованы в статье, принятой в печать (Safenkova et al. Anal. Bioanal. Chem. doi: 10.1007/s00216-016-0140-6).
Таким образом, сформированная панель биопроб может быть использована для первичной апробации разрабатываемых тест-систем.
Результаты, полученные в ходе выполнения проекта в 2016 г., позволяют выбрать наиболее перспективные иммунореагенты для применения в разрабатываемых иммунохроматографических системах и перейти к следующему этапу по включению полученных иммунореагентов в схемы амплификации для высокочувствительного мультипараметрического анализа.
Публикации
1. Сафенкова И.В., Зайцев И.А., Варицев Ю.А., Бызова Н.А., Дренова Н.В., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Development of a lateral flow immunoassay for rapid diagnosis of potato blackleg caused by Dickeya species Analytical and Bioanalytical Chemistry, - (год публикации - 2017) https://doi.org/10.1007/s00216-016-0140-6
Аннотация результатов, полученных в 2017 году
Работы по проекту, выполненные в 2017 г., были направлены на выбор наиболее эффективной схемы для мультипараметрического формата иммунохроматографического анализа патогенов картофеля, а также выбор протоколов амплификации для повышения чувствительности анализа. Для решения этих задач специфические реагенты, полученные и охарактеризованные на первом этапе работ, были использованы для получения двух типов мультипараметрических иммунохроматографических тест-систем: 1) тест-системы с использованием смешанных конъюгатов и 2) тест-системы в мультизонном варианте. Оба типа тест-систем решают задачи интегрального контроля нескольких патогенов в рамках одного анализа. Для выявления общей зараженности без дифференцировки конкретных возбудителей синтезировали конъюгат, способный связываться с каждым из определяемых патогенов благодаря иммобилизации на поверхности наночастиц золота (НЧЗ) антител разной специфичности (мультиспецифичный конъюгат). На основе мультиспецифичного конъюгата была впервые получена иммунохроматографическая тест-система, обладающая специфичностью к нескольким неродственным патогенам (X-, Y(N)-, Y(O)-, S-, M- вирусам картофеля и вирусу скручивания листьев картофеля). Сравнительная характеристика тест-систем показала, что пределы обнаружения патогенов не изменились при переходе на мультиспецифичный конъюгат и соответствовали 10-50 нг/мл (в зависимости от патогена) или 50-250 нг на 1 г листьев картофеля. Формирование комплексов конъюгат – патоген и их концентрирование в аналитической зоне происходит в присутствии как одного фитопатогена из определяемой группы, так и нескольких фитопатогенов.
Для идентификации возбудителей инфекции предложена схема мультизонной иммунохроматографической тест-системы, распознающей и дифференцирующей 10 патогенов одновременно (Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus, Pectobacterium atrosepticum, P. carotovorum subsp. сarotovorum и Dickeya subsp., X-, Y(N)-, Y(O)-, S-, M- вирусы картофеля и вирус скручивания листьев картофеля). В результате оптимизации выбраны параметры, обеспечивающие максимальную чувствительность и достоверность анализа: объем раствора при нанесении одной аналитической зоны (40-50 мкл), расстояние между аналитическими зонами (1 мм), минимальное расстояние от мембраны с конъюгатом (1,5 мм), количество рядов точек (10 аналитических рядов точек, каждая из которых содержит антитела, специфичные к одному из фитопатогенов, и 1 контрольный ряд точек с антивидовыми антителами), нитроцеллюлозная мембрана CNPC-10μ или CNPC-12μ («Advanced Microdevices», Индия), оптическая плотность конъюгатов (OD520 = 10 для каждого конъюгата). С одной стороны, выбранная геометрия не ограничивает формирование иммунных комплексов как при низкой, так и при высокой скорости ассоциации. С другой стороны, размер формируемой аналитической зоны не блокирует продвижение иммунных комплексов вместе с фронтом жидкости к расположенным выше аналитическим рядам. В результате для каждого из патогенов достигнут предел обнаружения, соответствующий ГОСТ Р 55329-2012 (10-50 нг/мл для вирусов и 10(4)-10(5) кл./мл для бактериальных патогенов).
Для решения задач высокочувствительной диагностики исследованы три основных направления амплификации в иммунохроматографии: (1) агрегация наночастиц, 2) ферментное усиление сигнала, 3) модификация метки в аналитической зоне – метод серебряного усиления. Применение подхода (1) показало, что одновременное использование конъюгата магнитных наночастиц (МНЧ) и золотых наночастиц в ИХА позволяет снизить предел обнаружения в 32 раза по сравнению с традиционным ИХА. Эффект основан на магнитном концентрировании и образовании гетероагрегатов между конъюгатом МНЧ – специфические антитела и конъюгатом НЧЗ – стрептавидин. Подход (2) основан на накоплении большого количества детектируемой метки, которая является продуктом ферментативной реакции. Амплификация была реализована при использовании пероксидазы хрена (ПХ) и щелочной фосфатазы (ЩФ). Наилучший результат получен для системы с двумя конъюгатами: НЧЗ – ЩФ – антивидовые IgG и НЧЗ – специфические антитела, взаимодействующими друг с другом в процессе формирования иммунных комплексов, детектируемых в аналитической зоне. Увеличение сигнала составляло от 30 до 400%. Предел обнаружения ИХА после добавления субстратной смеси BCIP/NBT был в 27 раз ниже по сравнению с традиционным ИХА без усиления. Подход (3) основан на восстановлении лактата серебра гидрохиноном, катализируемой наночастицами золота, входящими в состав конъюгатов со специфическими антителами. В результате реакции восстановления вокруг НЧЗ формируются крупные, ярко окрашенные частицы серебра, что приводит к значительному увеличению окрашивания аналитической зоны. Данный подход позволил снизить предел обнаружения в 15 раз по сравнению с традиционным ИХА без усиления. Предложено оригинальное решение по использованию стоп-реагента, прекращающего восстановление ионов серебра на поверхности НЧЗ и предотвращающего неспецифическое окрашивание, появление ложноположительных результатов. Время анализа, включая амплификацию, – 15 минут.
Все три подхода по амплификации ИХА обеспечили снижение минимальных определяемых концентраций более чем в 10 раз. С учетом простоты реализации, отсутствия дополнительных компонентов и универсальности применения для мультипараметрической амплификации выбрана амплификации, основанная на серебряном усилении. При использовании серебряного усиления для мультипараметрической тест-системы получено усиление от 10 до 60 раз в зависимости от фитопатогена.
Продолжены работы по получению реагентов для иммунодетекции вироида веретеновидности клубней картофеля (ВВКК). Синтезированы модифицированные препараты транскрипта ВВКК для иммунизации – транскрипт с диенплатиновой модификацией и транскрипт, ковалентно присоединенный к лизоциму. На основе обоих иммуногенов получены мышиные и кроличьи антисыворотки. Результаты дот-иммуноанализов показали, что антисыворотки животных, иммунизированных вироидной РНК, содержат антитела, специфичные к транскрипту ВВКК, специфично распознают природный ВВКК. Помимо этого, в препарате сывороток к транскрипту есть антитела, дающие кросс-реакцию с клеточной РНК. Из наиболее аффинных иммунных антисывороток кролика и из соответствующих преиммунных сывороток выделяли иммуноглобулины G осаждением сульфатом аммония. В сэндвич-формате иммуноферментного анализа показано, что полученные антитела распознают ВВКК в концентрации до 50 нг/мл (транскрипт ВВКК), однако наблюдаются неспецифические реакции при добавлении суммарной РНК незараженного растения.
Для разработки протоколов пробоотбора и пробоподготовки биопроб для ИХА были использованы здоровые и пораженные листья картофеля. Поражение материала было подтверждено методом ИФА во ВНИИ картофельного хозяйства им. Лорха (Красково, Московская область). Для пробоподготовки использовали два основных протокола. Первый обеспечивает лабораторную диагностику. Для его реализации навеску листьев измельчали в экстрагирующем буфере до получения грубодисперсной суспензии в массовом соотношении 1:10. Для получения искусственно контаминированных образцов в экстракты из здоровых листьев вносили известное количество одного из целевых фитопатогенов или их смесь (для мультипараметрических тест-систем). Второй протокол – для полевого анализа. Его особенностью стала адаптация, минимизация и упрощение всех этапов пробоподготовки для бесприборной реализации. Адаптированная комплектация тест-системы включала одноразовые устройства (пакетик с экстрагирующим буфером, одноразовые пипетки), вспомогательные устройства (магнит), аликвоты амплифицирующих реагентов. Особое внимание было уделено пробоподготовке для тест-систем с амплификацией, включающей дополнительные манипуляции с магнитным концентрированием, отмывкой или добавлением субстратных смесей. Подтверждена применимость обоих протоколов для мультипараметрического анализа растительного материала без снижения чувствительности относительно гомогенных антигенных препаратов.
Таким образом, результаты, полученные в 2017 г., позволяют выбрать наиболее перспективные протоколы и схемы амплификации для применения в мультипараметрической детекции патогенов картофеля. Тест-системы, изготовленные согласно выбранным схемам и протоколам, будут подробно охарактеризованы и пройдут апробацию на заключительном этапе проекта.
В 2017 г. 2 статьи опубликованы в журналах (Microchimica Acta, Food and Agricultural Immunology), 1 статья находится на рассмотрении (Analytica Chimica Acta), 1 статья подготовлена к подаче в редакцию (Chemical Communications).
Публикации
1. Панферов В.Г., Сафенкова И.В., Бызова Н.А., Варицев Ю.А., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Silver-enhanced lateral flow immunoassay for highly-sensitive detection of potato leafroll virus Food and Agricultural Immunology, - (год публикации - 2017) https://doi.org/10.1080/09540105.2017.1401044
2. Панфёров В.Г., Сафенкова И.В., Варицев Ю.А., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Enhancement of lateral flow immunoassay by alkaline phosphatase: a simple and highly sensitive test for potato virus X Microchimica Acta, - (год публикации - 2017) https://doi.org/10.1007/s00604-017-2595-3
3. Панферов В.Г., Сафенкова И.В., Разо Ш., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Применение магнитных частиц для иммунохроматографического анализа X вируса картофеля Тезисы докладов Третьего съезда аналитиков России, 124 (год публикации - 2017)
4. Разо Ш.С., Панфёров В.Г., Сафенкова И.В., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Double-enhancement based lateral flow immunoassay for potato virus X detection Biocatalysis -2017: Abstracts of 11th International Conference "Biocatalysis: Fundamentals and Applications", с. 190-191 (год публикации - 2017)
5. - Тесты для растений АгроБизнес, АГРОБИЗНЕС 2017. №6 (46), Стр. 120-126 (год публикации - )
Аннотация результатов, полученных в 2018 году
Работы, выполненные на заключительном этапе проекта в 2018 г., были направлены на детальную экспериментальную характеристику тест-систем для мультиплексной диагностики приоритетных вирусных и бактериальных заболеваний картофеля, включающих средства предварительного скринингового и подтверждающего тестирования. Для решения этих задач были получены серии иммунохроматографических тест-систем: 1) тест-системы для определения общей зараженности картофеля с использованием универсального мультиспецифичного конъюгата (скрининговый тест), 2) тест-системы для одновременной детекции и идентификации до 10 патогенов в пробе с высокой чувствительностью благодаря, достигаемой благодаря амплификации сигнала (подтверждающий тест). Оба формата тест-систем имеют открытую конфигурацию, что позволяет включать в перечень диагностируемых объектов различные значимые патогены картофеля (возбудители черной ножки и кольцевой гнили (Pectobacterium atrosepticum, P. carotovorum subsp. сarotovorum, Dickeya spp., Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus, вирусы скручивания листьев картофеля (ВСЛК), X-, Y-, M- и S-вирусы картофеля (ХВК, YВК, MВК, SВК), вироид веретеновидности листьев картофеля (ВВКК)), а также обеспечивает основу для включения в анализ других картофельных патогенов.
Для скринингового иммунохроматографического анализа (ИХА) была установлена оптимальная комплектация, включающая мультиспецифичный конъюгат смеси антител разной специфичности и золотых наночастиц. Показано, что при комплектации скринингового теста для определения общей зараженности, обусловленной пятью патогенами, аналитические характеристики сопоставимы с монопараметрическими тест-системами. При этом производительность анализа выше благодаря одновременному выявлению пяти патогенов в одной пробе. В качестве основных объектов, для которых был реализован скрининговый ИХА, выбрали вирусные патогены: ХВК, YВК, MВК, SВК, ВСЛК. Установлены следующие пределы обнаружения: 10 нг/мл для XВК, 20 нг/мл для YВК и MВК, 30 нг/мл для ВСЛК и SВК. Компоненты растительного матрикса не оказывают влияния на характеристики анализа. Показано отсутствие ложно положительных и отрицательных результатов. Данный подход может использован для массового тестирования фитопатогенов в условиях ограниченного времени (например, таможенный фитосанитарный контроль). Для анализа не требуется дополнительного оборудования и реагентов. Продолжительность тестирования составляет 10 мин. Предложенный формат тест-системы значительно упрощает рутинный скрининг основных вирусов картофеля и повышает его производительность.
Для подтверждающей мультизонной иммунохроматографической тест-системы в рамках проекта стояла задача обеспечить низкие пределы обнаружения (≤ 10(4) кл./мл – для бактерий, ≤ 10 нг/мл – для вирусов, ≤ 10 нг/мл – для вироида), сохраняя продолжительность тестирования до 30 минут. Проведённые на предыдущем этапе исследования позволили выбрать условия изготовления тест-полосок, проведения анализа и способ амплификации, обеспечивающие наименьший предел обнаружения и высокую достоверность диагностики. За весь период выполнения проекта предложено и охарактеризовано четыре типа амплификационных решений: 1) одновременное использование конъюгата магнитных наночастиц (МНЧ) и золотых наночастиц (НЧЗ) – агрегация наночастиц, 2) ферментное усиление сигнала благодаря использованию дополнительного конъюгата с щелочной фосфатазой, 3) модификация метки в тестовой зоне восстановлением ионов серебра на поверхности НЧЗ – метод серебряного усиления, 4) модификация метки в тестовой зоне восстановлением ионов золота на поверхности НЧЗ – метод золотого усиления. Из всех разработанных нами подходов наиболее простым является серебряное усиление. Золотое усиление обеспечивает значительное увеличение интенсивности окрашивания, однако из-за высокой оптической плотности смеси конъюгатов, характерной для мультиплексной тест-системы, применение данного методического подхода ограничивается возможным фоновым окрашиванием. Серебряное усиление не требует введения в систему дополнительных реагентов (ферментных меток, конъюгатов со стрептавидином). Таким образом, несмотря на необходимость отмывки тест-полосок, данный подход оптимален для подтверждающего теста. Использование серебряного усиления для подтверждающего мультиплексного анализа позволило снизить пределы обнаружения вирусов до 16 раз по сравнению с мультизонным тестом без усиления (пределы обнаружения ХВК и ВСЛК- 2 нг/мл, МВК, SВК, Y(N)ВК – 4 нг/мл, Y(O)ВК – 8 нг/мл) и бактерий до 10 раз (P. carotovorum и Dickeya spp – 104 клеток/мл, P. atrosepticum – 10(4) клеток/мл, C. michiganensis – 10(3) клеток/мл). Разработанный подтверждающий тест позволяет выявлять и дифференцировать до десяти патогенов вирусной и бактериальной природы в одном образце.
Для характеристики иммунохимического определения вироида веретеновидности клубней картофеля (ВВКК) in vitro, что является отдельной нетривиальной задачей в рамках проекта, собирали несколько вариантов иммунохроматографических тест-систем с нитроцеллюлозной рабочей мембраной CNPF-SN12 (10 µ), на которой формировали зоны связывания двух видов: точки и линии. В тестовых зонах связывания иммобилизовали антитела, полученные при иммунизации конъюгатом вироидная РНК-лизоцим. Контрольную зону формировали, иммобилизуя антитела, специфичные к мышиным иммуноглобулинам G. Для детекции иммунных комплексов синтезировали конъюгаты НЧЗ (диаметр 25 нм) с антителами, полученными при иммунизации конъюгатом вироидная РНК-лизоцим. В результате оптимизации условий для иммунохроматографического определения ВВКК предложено: 1) проведение анализа в буфере с высокой ионной силой (15 мМ фосфатный буфер, содержащий 300 мМ NaCl), 2) проведение предварительной инкубации антител с тотальным препаратом дрожжевой РНК для исключения неспецифических реакций. Предложенная иммунохроматографическая тест-система показала эффективное обнаружение ВВКК при низких концентрациях РНК и больших разведениях экстракта. Полученная зависимость интенсивности окраски тестовой зоны от концентрации ВВКК имеет линейный диапазон в интервале от 20 до 500 нг/мл, предел обнаружения – 10 нг/мл. Отметим, что для анализа проб картофеля наилучший результат достигается при включении дополнительной стадии обогащения ВВКК посредством предварительной экстракции суммарной РНК (или ее низкомолекулярной составляющей) и концентрирования спиртом.
Для достоверного документирования результатов экспрессного анализа и максимально информативной обработки полученных данных (количественное определение содержания фитопатогенов) использовали видеоцифровую измерительную технику, что обеспечивает возможность работы не с интегральной характеристикой яркости полосы в анализируемой зоне, а со всем массивом информации о распределении окраски. Для этой цели применяли портативный детектор отечественного производства – анализатор «Рефлеком» с программным обеспечением «Видеотест». Портативный прибор попиксельно регистрировал каждую зону связывания. Этот подход применяли для иммунохроматографических тест-систем без амплификации сигнала и с амплификацией. Для разных вариантов амплификации сигнала, используемых в проекте, цвет тестовой зоны изменялся от красного (маркер – наночастицы золота без усиления или усиление как следствие агрегационных взаимодействий) до синего (ферментное усиление, золотое усиление) и коричнево-черного (серебряное усиление, усиление с использованием магнитных наночастиц). Портативный детектор достоверно регистрировал сигнал на мембранах при любом цвете тестовой зоны. Для тест-систем с усилением регистрацию проводили сразу после прохождения реакции, не дожидаясь высыхания. Для сравнения использовали систему регистрации, сочетающую сканирование и последующую обработку в программе «TotalLab», версия 2.01 («Nonlinear Dynamics», Великобритания). Этот способ удобен для одновременной обработки большого массива тест-систем в лабораторных условиях. На стадии разработки иммунохроматографических систем и амплификационных подходов использовался этот тип регистрации. Портативный детектор обеспечивает предел обнаружения на порядок ниже, чем визуальная оценка благодаря достоверной регистрации слабоокрашенных тестовых зон, наблюдаемых при очень низких концентрациях патогенов: ≤ 10(3) кл./мл для бактерий, ≤ 1 нг/мл для вирусов.
В рамках работ 2017-2018 гг. изучали стабильность тест-систем при хранении. Хранение тест-полосок при комнатной температуре в течение 360 дней не оказывает влияния на интенсивность окрашивания тестовой зоны, а также на чувствительность разработанных тест-систем. Хранение не влияет ни на величину неспецифичного окрашивания (для отрицательных контролей фон не детектируется), ни на степень вымывания конъюгата со стекловолоконной мембраны. Также показано, что для увеличения стабильности компонентов для проведения серебряного усиления оптимально использование навесок лактата серебра и гидрохинона. Приготовление растворов и их смешивание проводится непосредственно перед проведением усиления. Предложенный протокол серебряного усиления ИХА решает проблемы, связанные с низкой стабильностью исходных компонентов и позволяет использовать данный подход для внелабораторной диагностики.
Разработанные тест-системы для скринингового и подтверждающего анализа не имеют литературных и коммерческих аналогов. Поэтому для сопоставления были выбраны монопараметрические иммунохроматографические тест-системы отечественного и зарубежного (Bioreba AG, Швейцария) производства. Сравнение показало следующие результаты:
1) скрининговая тест-система и мультизонная тест-система без амплификации сигнала, идентифицирующая до 10 патогенов в пробе, не уступают по чувствительности коммерческим монопараметрическим тест-системам;
2) мультизонная тест-система с амплификацией сигнала на 1-2 порядка (в зависимости от патогена) чувствительнее, чем коммерческие монопараметрические тест-системы;
3) время анализа для скрининговой и мультизонной тест-систем без амплификации сигнала равно 10 минутам, что соответствует времени анализа коммерческих тест-систем;
4) время анализа для мультизонной тест-системы с амплификацией больше, чем для коммерческих тест-систем – при самом быстром способе амплификации – 13 минут (золотое усиление), при самом длительном способе– 30 минут (агрегация функционализированных магнитных наночастиц и золотых наночастиц);
5) производительность скрининговой тест-системы в 5 раз выше, чем коммерческих тест-систем;
6) производительность мультизонной тест-системы в 8-10 раз выше, чем коммерческих тест-систем;
7) эффективность диагностики (достоверность получаемых положительных и отрицательных результатов) в полевых условиях с использованием разработанных тест-систем не хуже, чем для коммерческих.
Таким образом, разработанные тест-системы обладают рядом конкурентных преимуществ относительно коммерческих монопараметрических тест-систем и представляются востребованными в качестве серийно производимых изделий. Внедрение новых средств производительного тестирования в массовую практику повысит эффективность диагностики инфекций и, благодаря этому – приведет к снижению потерь выращиваемого картофеля. В рамках проекта проведено обсуждение с потенциальным производителем тест-систем (ООО «РЭД», http://red-test.ru/) планов организации серийного производства.
Эффективность разработанных тест-систем подтверждали на репрезентативных массивах партий семенного картофеля. Для этого совместно с ВНИИ Картофельного хозяйства им. А.Г. Лорха (Московская обл., п. Красково) были отобраны партии семенного картофеля из разных регионов РФ, представленные наиболее распространенными сортами семенного картофеля. В зависимости от категории семенного картофеля и организации-поставщика в партию входило от 1 до 200 клубней. Для оценки эффективности тест-систем при анализе надземных частей картофеля собирали коллекцию листьев в полевой вегетационный сезон. Партии визуально оценивали, отмечали наличие симптомов инфекции, проводили иммуноферментный анализ на основные вирусные и бактериальные патогены картофеля. Помимо этого, использовали искусственно зараженные растения и пробирочные растения, свободные от инфекций. В результате сбора клубневого и листового материала картофеля была сформирована репрезентативная панель проб (120 клубневых, 170 листовых), для которой методом иммуноферментного анализа показано присутствие вирусных и бактериальных инфекций, детектируемых в рамках проекта. Для скрининговой тест-системы как качественного метода анализа определена достоверность в пределах от 95 до 100% при сравнении с результатами иммуноферментного анализа. Эти результаты подтверждают, что скрининговый иммунохроматографический тест для определения общей зараженности может использоваться как простой, быстрый (10 минут) и эффективный метод обнаружения болезней картофеля без дифференциации.
Для разработанных иммунохроматографических тест-систем, идентифицирующих конкретный патоген с высокой чувствительностью благодаря амплификации, было определено большее количество зараженных образцов, чем указано при паспортизации методом иммуноферментного анализа (53 образца). Эти результаты дополнительно верифицировали методом полимеразной цепной реакции, подтвердившей наличие патогенов в пробе. Достоверность результатов находилась в пределах от 95 до 100%.
Результаты, полученные в 2018 г., позволяют заключить, что разработанные в рамках проекта тест-системы для предварительного скринингового и подтверждающего тестирования являются перспективным инструментом диагностики приоритетных вирусных и бактериальных заболеваний картофеля.
В 2018 г. 6 статей опубликовано/принято к публикации в журналах, индексируемых в базах данных Web of Science и Scopus (Analytica Chimica Acta, Microchimica Acta, Talanta, Sensors, Российские нанотехнологии); кроме того, вышло 5 публикаций в изданиях, индексируемых РИНЦ.
Подана заявка на полезную модель «Иммунохроматографическая тест-система для определения общей вирусной зараженности картофеля, вызванной пятью патогенами».
Проведена очная научно-практическая конференция «Нормативное регулирование и современные методы диагностики патогенов в семеноводстве картофеля» при участии более 60 представителей научно-исследовательских и производственных организаций – руководители фирм по производству семенного картофеля, специалисты по выращиванию и хранению картофеля, селекционеры, научные сотрудники.
Публикации
1. Панфёров В.Г., Самохвалов А.В., Сафенкова И.В., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Изучение роста нативных и модифицированных белками наночастиц золота в присутствии гидроксиламина и тетрахлораурата Российские нанотехнологии, - (год публикации - 2018)
2. Панферов В.Г., Сафенкова И.В., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Post-assay growth of gold nanoparticles as a tool for highly sensitive lateral flow immunoassay. Application to the detection of potato virus X MICROCHIMICA ACTA, Том: 185 Выпуск: 11 (год публикации - 2018) https://doi.org/10.1007/s00604-018-3052-7
3. Разо Ш., Панферов В.Г., Сафенкова И.В., Варинцев Ю.А., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Double-enhanced lateral flow immunoassay for potato virus X based on a combination of magnetic and gold nanoparticles ANALYTICA CHIMICA ACTA, Том: 1007 Стр.: 50-60 (год публикации - 2018) https://doi.org/10.1016/j.aca.2017.12.023
4. Разо Ш., Панферов В.Г., Сафенкова И.В., Варинцев Ю.А., Жердев А.В., Пакина Е.Н., Дзантиев Б.Б. How to Improve Sensitivity of Sandwich Lateral Flow Immunoassay for Corpuscular Antigens on the Example of Potato Virus Y? Sensors (Basel), том: 18(11), Стр.: 3975 (год публикации - 2018) https://doi.org/10.3390/s18113975
5. Сафенкова И.В., Панферов В.Г., Панферова Н.А., Варинцев Ю.А., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Alarm lateral flow immunoassay for detection of the total infection caused by the five viruses Talanta, Volume 195, Pages 739-744 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1016/j.talanta.2018.12.004
6. Бутенко К.О., Гасанова Т.В., Королёва А.А., Голдобина Е.Е., Сафенкова И.В., Дрыгин Ю.Ф. Получение и характеристика антител к РНК вироида веретёновидности клубней картофеля Сборник трудов международной научно-практической конценренции "Молекулярная диагностика 2018", Сс. 411-412 (год публикации - 2018)
7. ГОЛДОБИНА Е.Е., БУТЕНКО К.О., ГАСАНОВА Т.В., КОРОЛЁВА А.А., ИВАНОВ П.А., ДРЫГИН Ю.Ф. ИММУНОХИМИЧЕСКОЕ ОПРЕДЕЛЕНИЕ РНК ВИРОИДА ВЕРЕТЕНОВИДНОСТИ КЛУБНЕЙ КАРТОФЕЛЯ (PSTVD) Сборник тезисов XVIII Всероссийской конференции молодых учёных, посвященной памяти академика РАСХН Георгия Сергеевича Муромцева. 2018, Страницы: 82-83 (год публикации - 2018)
8. ПАНФЕРОВ В.Г КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ЕДИНИЧНЫХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЙ ВИРУС-АНТИТЕЛО И РАЗРАБОТКА ИММУНОХИМИЧЕСКИХ МУЛЬТИПЛЕКСНЫХ СИСТЕМ ДЕТЕКЦИИ ВИРУСНЫХ И БАКТЕРИАЛЬНЫХ ФИТОПАТОГЕНОВ СБОРНИК ТЕЗИСОВ ОТЧЕТНОЙ КОНФЕРЕНЦИИ АСПИРАНТОВ: НАПРАВЛЕНИЕ ПОДГОТОВКИ 06.06.01 "БИОЛОГИЧЕСКИЕ НАУКИ" Тезисы ежегодной отчетной конференции аспирантов. Под редакцией В.О. Попова, К.Г. Скрябина. Составитель Е.С. Титова. 2018, Страницы: 63-67 (год публикации - 2018)
9. Панфёров В.Г., Сафенкова И.В., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Approaches to decreasing the detection limit of lateral flow immunoassay Book of Abstracts of the 12th Conference in the Rapid Methods Europe (RME2018)., - (год публикации - 2018)
10. Сафенкова И.В., Панферов В.Г., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Enhancing nanoparticle-based approaches for ultrasensitive immunoassays Abstract Book The 9th International Conference "Biomaterials and Nanobiomaterials: Recent Advances Safety-Toxicology and Ecology Issues, - (год публикации - 2018)
11. САФЕНКОВА И.В., ПАНФЕРОВ В.Г., ЖЕРДЕВ А.В., ДЗАНТИЕВ Б.Б. Амплификация сигнала в иммунохроматографическом анализе фитопатогенов "БИОТЕХНОЛОГИЯ: СОСТОЯНИЕ И ПЕРСПЕКТИВЫ РАЗВИТИЯ" Материалы международного форума 2018., Страницы: 799-800 (год публикации - 2018)
12. САФЕНКОВА И.В., ПАНФЕРОВ В.Г., НЕМЧЕНКО Н.А., ВАРИЦЕВ Ю.А., ЗАЙЦЕВ И.А., ВАРИЦЕВА Г.П., ГАЛУШКА П.А., УСКОВ А.И., ЖЕРДЕВ А.В., ДЗАНТИЕВ Б.Б. ИММУНОХРОМАТОГРАФИЧЕСКАЯ ТЕСТ-СИСТЕМА ДЛЯ ОДНОВРЕМЕННОГО КОНТРОЛЯ ДЕСЯТИ ПАТОГЕНОВ КАРТОФЕЛЯ Материалы научно-практической конференции "Современное состояние и перспективы развития селекции и семеноводства картофеля" . Под ред. С.В. Жеворы. 2018, Страницы: 232-245 (год публикации - 2018)
13. Сафенкова И.В., Панфёров В.Г., Панфёрова Н.А., Варицев Ю.А. Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Иммунохроматографическая тест-система для определения общей вирусной зараженности картофеля, вызванной пятью патогенами -, 2018144243 (год публикации - )
Возможность практического использования результатов
В рамках проекта разработаны скрининговые и подтверждающие иммунохроматографические тест-системы для диагностики основных экономически значимых бактериальных, вирусных и вироидных патогенов картофеля. Тест-системы удовлетворяют всем критериям для практического применения – экспрессность (время анализа, включая этапы подготовки проб, проведения анализа и его амплификации – не более 20-25 минут), низкие пределы обнаружения для детекции латентных инфекций, минимальная трудоемкость проведения анализа и интерпретации результатов. Разработанные тест-системы могут быть использованы для высокопроизводительного скрининга фитопатогенов (более 40 проб в час) во внелабораторных условиях. Эффективность детекции фитопатогенов показана на большой репрезентативной выборке зараженных и здоровых растений из разных регионов РФ. Полученные результаты предоставляют научно-методическую основу для создания серийного производства экспрессных иммунохроматографических тест-систем.