КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 19-44-02020

НазваниеРазработка систем экспрессного контроля тяжелых металлов в воде различного назначения для экологического мониторинга и предотвращения рисков для здоровья

РуководительБерлина Анна Николаевна, Кандидат химических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное учреждение "Федеральный исследовательский центр "Фундаментальные основы биотехнологии" Российской академии наук", г Москва

Период выполнения при поддержке РНФ 2019 г. - 2021 г. 

Конкурс№32 - Конкурс 2018 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований международными научными коллективами» (DST).

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни, 04-302 - Химическая экология

Ключевые словаТяжелые металлы, биоанализ, биосенсоры, токсичные загрязняющие вещества, иммунологические анализы, аптамерные анализы, нанодисперсные метки, анализ в латеральном потоке, анализ в поперечном потоке, загрязнение пищевых продуктов, загрязнение окружающей среды

Код ГРНТИ31.01.17


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Интенсификация промышленной деятельности и урбанизация общества обуславливают значительный рост рисков, связанных с попаданием токсичных контаминант в окружающую среду и продукты питания. В последние годы возрастают негативные эффекты, обусловленные воздействием тяжелых металлов, возрастанием их уровня в пищевых цепях, накоплением в организмах сельскохозяйственных животных и человека. Особенно выражены эти проблемы для стран Азиатского региона. Эффективное предотвращение этих воздействий требует организации широкого мониторинга загрязнений, основанного на применении высокочувствительных и производительных аналитических методов для контроля тяжелых металлов. Имеющиеся аналитические средства не позволяют эффективно решать эту задачу. В современной практике в основном представлены два направления: высокочувствительные аналитические методы, ориентированные на применение высокотехнологичного дорогого оборудования, и методы экспресс-диагностики на основе простых химических цветных реакций, характеризующиеся сравнительно невысокой чувствительностью и селективностью, а также значительным влиянием матрикса проб на результаты анализа. Нехватка систем для быстрого внелабораторного анализа наиболее критична для оценки высокотоксичных металлов (ртуть, свинец), которые необходимо контролировать в малых концентрациях. Проект направлен на разработку, сравнительную характеристику и апробацию новых аналитических методов для детекции ионов тяжелых металлов, в которых используется их специфическое взаимодействие с биорецепторными молекулами белковой (антитела) и олигонуклеотидной (аптамеры) природы в сочетании с применением нанодисперсных маркеров для генерации детектируемого оптического сигнала. В последние годы реализован ряд новых подходов, расширяющих возможности биорецепторного анализа. Включение ионов тяжелых металлов в хелатные комплексы обеспечило возможность наработки антител, селективно распознающих тяжелые металлы. С использованием различных вариантов SELEX-технологии отобран ряд высокоаффинных олигонуклеотидных рецепторов. Опубликованы результаты разработки ряда высокочувствительных аналитических систем для контроля тяжелых металлов (преимущественно в водных ресурсах), использующих данные рецепторы. Однако переход к массовому применению таких методов на практике в существенной степени лимитируется недостаточной селективностью таких систем и потенциальным влиянием матрикса различных многокомпонентных проб на результаты тестирования. В рамках проекта предполагается объединить наиболее эффективные методические решения по биорецепторной детекции тяжелых металлов, разработать на их основе новые высокочувствительные аналитические методы и охарактеризовать их эффективность как средств контроля различных объектов окружающей среды и видов пищевой продукции. Принципиальными особенностями разработки будет применение биорецепторных взаимодействий в мембранных системах продольного и поперечного потока, что позволит при минимальной трудоемкости анализа разделить компоненты матрикса и детектируемые комплексы. Кроме того, в рамках проекта будет проведена сравнительная характеристика различных нанодисперсных маркеров – частиц металлов, оксидов металлов, многослойных полупроводниковых композитов разных размеров и формы – для оценки их эффективности в качестве фото- и флуориметрических маркеров детектируемых комплексов. Для обеспечения высокой чувствительности детекции будут реализованы различные варианты сборки мультикомпонентных композитов из функционализованных наночастиц разных видов. Переход от детекции единичной маркерной частицы в составе рецепторного комплекса к регистрации оптического сигнала от агрегата из нескольких сотен и тысяч частиц позволит снизить предел обнаружения анализа и при контроле превышения нормируемых уровней контаминант работать с разбавленными пробами, тем самым минимизируя неспецифическое влияние компонентов матрикса проб на аналитический сигнал. При этом принципиальным элементом исследования будет выбор универсальных аналитических протоколов, проверка их эффективности на протяжении всех цепочек циркуляции и накопления тяжелых металлов в экосистемах, кормовых и пищевых цепях.

Ожидаемые результаты
Критерием успешной реализации проекта будет получение следующих основных результатов: - выявление взаимосвязей между характеристиками антител, аптамеров и маркеров, используемых в аналитических системах, и пределом детекции целевого аналита (ртуть, свинец); оценка факторов, влияющих на результаты проведения анализа; - сравнительная характеристика наночастиц и биорецепторных молекул, выбор и обоснование критериев выбора маркеров для биоаналитических систем; - разработка наиболее эффективных методик получения конъюгатов нанодисперсных носителей и биорецепторных молекул для иммунофильтрационных систем и иммунохроматографии; - оценка выбранных маркеров и их сравнение со средствами детекции иммунных комплексов, используемыми в традиционных аналитических системах; - характеристика корреляции результатов, получаемых традиционными и разработанными методами анализа, оценка полноты выявления целевых аналитов в различных объектах окружающей среды (вода, продукты питания почва); - разработка методических решений для комплексного мониторинга токсичных веществ разных классов в окружающей среде; - подготовка технологических решений для масштабируемого изготовления разработанных тест-систем, подтверждение стабильности при хранении аналитических параметров экспериментальных образцов тест-систем. Для предлагаемых тест-систем, разработанных в результате выполнения проекта, должна быть показана возможность выявления тяжелых металлов (свинца, ртути) в концентрациях ниже предельно допустимых уровней контаминации объектов окружающей среды, установленных российскими и международными нормативами. Процент открытия определяемых катионов с использованием каждого разработанного метода должен составлять не менее 80% от введенной концентрации. Коэффициент корреляции результатов анализа с данными подтверждающих методов должен быть выше, чем r = 0,9. Предлагаемые методы должны обеспечивать точность определения аналитов, характеризующуюся среднеквадратичным отклонением результатов измерений в серии не более 10%. Продолжительность тестирования должна составлять не более 20 мин. Аналитические параметры тест-систем не должны претерпевать статистически значимых изменений при их хранении на протяжении не менее чем 12 месяцев. Планируемые способы обнародования результатов, полученных в ходе выполнения проекта, включают: - подготовку и публикацию научных статей по вопросам разработки и характеристики новых биоаналитических систем: не менее 11 статей – в изданиях, индексируемых в базах данных «Сеть науки» (Web of Science) или «Скопус» (Scopus); для обеспечения высокого уровня публикаций планируется издание не менее половины из них в журналах, относящихся к первой или второй квартилям баз данных WoS или Scopus; - представление результатов исследований на профильных научных мероприятиях; - популярные тексты для потенциальных конечных пользователей тест-систем, публикуемые в отраслевых бумажных изданиях или Интернет-ресурсах; - экспериментальные образцы новых тест-систем, доступные для проведения совместных испытаний с организациями - потенциальными конечными пользователями. Разработанные тест-системы будут доступны для совместных испытаний и учета особенностей различных классов тестируемых проб – как в рамках планируемых работ по проекту (на основании сформированного научно-технологического сотрудничества), так и в режиме «открытой площадки» (взаимодействия с новыми заинтересованными организациями). Практическая реализация данных разработок обеспечит основу для серийного производства новых тест-систем и их внедрения в практику, способствующего эффективной защите здоровья потребителей.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2019 году
Основной задачей трехлетнего исследования является структурно-функциональное изучение комплексов наночастиц разной химической природы с биорецепторными молекулами белковой (антитела) и олигонуклеотидной (аптамеры) природы и их применение для создания высокочувствительных методов детекции ионов тяжелых металлов. Одной из актуальных задач является разработка высокочувствительных и производительных аналитических методов для контроля тяжелых металлов с целью проведения широкого мониторинга загрязнений окружающей среды. Имеющиеся аналитические лабораторные методы или экспресс-методы на основе простых химических цветных реакций не позволяют решить данную задачу из-за необходимости наличия высокотехнологичного дорогого оборудования или невысокой чувствительности и селективности анализа, соответственно. Поэтому в рамках проекта предлагается объединить наиболее эффективные методические решения по биорецепторной детекции тяжелых металлов, такие как: • применение в качестве эффективных фото- и флуориметрических маркеров детекции комплексов различных нанодисперсных частиц металлов, оксидов металлов, многослойных полупроводниковых композитов разных размеров и формы; • применение биорецепторных взаимодействий в мембранных системах продольного и поперечного потока, минимизирующих трудоемкость анализа за счет разделения компонентов пробы и детектируемых комплексов; • реализация подходов для снижения предела обнаружения анализа, в том числе переход от детекции единичной маркерной частицы к регистрации оптического сигнала от агрегата из нескольких сотен и тысяч частиц. Реализация данного проекта предполагает получение сравнительной характеристики различных нанодисперсных маркеров и биорецепторных молекул, выбор эффективных аналитических протоколов и формирование фундаментальных основ для биотехнологий производства тест-систем для определения тяжелых металлов (свинца, ртути) в объектах окружающей среды. Результатом выполнения работ по проекту будет выявление взаимосвязей между характеристиками биорецепторных молекул и нанодисперсных маркеров, используемых в тест-системах, и пределом обнаружения целевых аналитов, а также разработка иммунохроматографических и иммунофильтрационных систем контроля токсичных веществ на основании полученных выводов и методических решений по чувствительному определению катионов тяжелых металлов. Для понимания особенностей иммобилизации антител и аптамеров на поверхности наночастиц, а также взаимодействия конъюгатов маркер – биорецепторная молекула с детектируемыми соединениями работы 2019 года были направлены на получение и характеристику конъюгатов, различающихся по: - виду наночастиц-носителей, - размерам и составу наночастиц; - способам иммобилизации. Охарактеризованы реагенты для специфической детекции ртути и свинца, а также синтезированные в лаборатории наночастицы коллоидного золота разного размера и полученные в кооперации с индийским партнером по проекту наночастицы состава Ag-Au, Ag-Cu. Проведена оценка сродства препаратов немодифицированных антител к тяжелым металлам методами иммуноферментного анализа с использованием соответствующего комплекса иона с хелатирующим агентом. Охарактеризованы препараты немодифицированных аптамеров методом малоуглового рентгеновского рассеяния с использованием синхротронного излучения. Проведена оценка селективности немодифицированных антител и аптамеров к определяемому иону с использованием метода иммуноферментного анализа. Разработана методика оценки селективности с использованием метода спектрофотометрии. Данная методика основана на выявлении разницы оптической плотности при 620 нм растворов аптамеров, модифицированных и немодифицированных наночастицами золота, соответственно. Определены размерные и поверхностные характеристики немодифицированных цитрат-стабилизированных наночастиц золота и конъюгатов на их основе с использованием методов молекулярной электронной спектроскопии, просвечивающей электронной микроскопии, методов динамического рассеяния света и дифракции обратно рассеянных электронов, Ик-спектроскопии Фурье. Показана взаимодополняемость характеристик наночастиц, получаемых разными методами. Получены конъюгаты нанодисперсных маркеров с олигонуклотидными последовательностями различного состава путем специфического взаимодействия тиольных групп с поверхностью наночастиц. Показано влияние концентрации биорецепторных молекул на предел обнаружения целевых аналитов. Проведена апробация полученных препаратов модифицированных нанодисперсных маркеров в гомогенном анализе. Разработана методика определения сурьмы, основанная на взаимодействии золотых наночастиц, модифицированных поли-А аптамером и регистрации результата визуально или методом фотометрии. Применение разработанной методики позволяет проводить определение сурьмы (III) в питьевой воде с пределом обнаружения 10 нг/мл и продолжительностью анализа 2 минуты. Продемонстрирована возможность повышения чувствительности электрохимического определения катионов мышьяка при замене золотых наночастиц на наночастицы состава Ag-Au и использовании аптамера сложного состава. Показана высокая чувствительность (1 мкг/мл) гомогенного анализа ртути с использованием золотых наночастиц, модифицированных поли-А аптамером. Отмечено также взаимодействие и с рядом других катионов, например, As3+, Cr3+, Mn2+, Pb2+, когда их концентрация превышает 0,3 мкг/мл, 0,6 мкг/мл, 1 и 1 мкг/мл, соответственно. Для разработки гетерогенного формата анализа (иммунохроматография) получены комплексы белков с различными рецепторными молекулами и конъюгаты на их основе с нанодисперсными маркерами. Проведена характеристическая оценка препаратов конъюгатов методом УФ-спектрофотометрии. Применение разработанной методики гомогенного анализа в сопровождении с хроматографическим разделением позволяет снизить предел обнаружения катионов свинца до 1 нг/мл.

 

Публикации

1. Берлина А.Н., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Экспрессные колориметрические методы определения тяжелых металлов: Применение поли-Т-олигонуклеотида в качестве рецепторной молекулы Наука: комплексные проблемы, № 1 (13), с. 105-109 (год публикации - 2019)

2. Берлина А.Н., Комова Н.С., Жердев А.В., Гаур М.С., Дзантиев Б.Б. Colorimetric technique for antimony detection based on the use of gold nanoparticles conjugated with poly-A oligonucleotide Applied Sciences, v. 9, N 22, article 4782. DOI: 10.3390/app9224782 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.3390/app9224782

3. Берлина А.Н., Комова Н.С., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Application of aminophenylboronic acid conjugated with protein carrier for aptachromatographic detection of lead ion AIP Conference Proceedings, - (год публикации - 2020)

4. Кушвах М., Гаур М.С., Арора К., Берлина А.Н. Bio synthesis of colloidal AuNPs using thermally assisted pulse sonication method Materials Research Express, v. 16, N 11, article 115068 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1088/2053-1591/ab4a69

5. Кушвах М., Гаур М.С., Берлина А.Н., Арора К. Biosynthesis of novel Ag@Cu alloy NPs for enhancement of methylene blue photocatalytic activity and antibacterial activity Materials Research Express, v. 16, N 11, article 116561 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1088/2053-1591/ab485e

6. Ядав Р., Кушвах В., Гаур М.С., Берлина А.Н., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Electrochemical aptamer biosensor for As3+ based on apta deep trapped Ag-Au alloy nanoparticles-impregnated glassy carbon electrode International Journal of Environmental Analytical Chemistry, c.1-12 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1080/03067319.2019.1638371

7. Берлина А.Н., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Nanoparticle-aptamer conjugates as a tool for heavy metals detection Aptamers in Bordeaux, Bordeaux, France, June 28-29, 2019, P47, page 81 (год публикации - 2019)

8. Берлина А.Н., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Determination of heavy metals with the use of gold nanoparticles modified with aptamers ХХI Mendeleev Congress on General and Applied Chemistry. Book 4: Abstracts,Saint Petersburg, September, 9-12, 2019, Volume 4, Section 7, Page 323 (год публикации - 2019)

9. Берлина А.Н., Комова Н.С., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Application of aminophenylboronic acid conjugated with protein carrier for aptachromatographic detection of lead ion 3rd International Conference «Modern Synthetic Methodologies for Creating Drugs and Functional Materials» Book of Abstracts, Yekaterinburg, Russia, November 13 - 16, 2019, DR-5 (год публикации - 2019)

10. Берлина А.Н., Комова Н.С., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Application of aptamers for the determination of heavy metals Molecular Therapy Nucleic Acids, 1st International Conference «Aptamers in Russia 2019». Book of Abstracts. August 27-30, 2019. Krasnoyarsk, Russia, Volume 17, Supplement 1, Pages 15-16 (год публикации - 2019)

11. Еремин С.А., Жердев А.В., Самохвалов А.В., Сафенкова И.С., Комова Н.С., Берлина А.Н., Дзантиев Б.Б Nanoparticles for rapid optical: their use as carriers for receptor molecules and signal transformers Nanotech Eurasia 2019 First Eurasian Conference on Nanotechnology, Baku, Azerbaijan, October 3-4, 2019, Pages 65-66 (год публикации - 2019)


Аннотация результатов, полученных в 2020 году
Основной задачей трехлетнего исследования является разработка новых чувствительных и селективных тест-систем для определения ионов тяжелых металлов для проведения мониторинга в различных объектах окружающей среды. Методики, используемые на данный момент в мониторинге, предполагают использование сложного дорогостоящего оборудования, либо экспресс-методики с недостаточным пределом обнаружения. Поэтому второй год проекта посвящен изучению закономерностей экспрессной детекции тяжелых металлов, а также подготовке и характеристике соответствующих тест-систем. Разработано несколько вариантов тест-систем, основанных на двух форматах определения аналитов – гомогенном (агрегационном либо каталитическом) и гетерогенном (хроматографическом, мембранном), в том числе продемонстрирована возможность сочетания с методом ГКР и электрохимическими методами. Для каждого вида анализа подобран комплект реагентов – от синтезируемых конъюгатов для иммобилизации на мембрану (БСА с аминофенилборной кислотой и глутатионом) до проявляющих конъюгатов золотых наночастиц с рецепторными молекулами: • наночастицы с аптамерами (для гомогенных и хроматографических систем определения ртути и свинца); • наночастицы с меркаптоянтарной кислотой, иммобилизованной на их поверхность (для определения ртути и кадмия); • наночастицы с меркаптоянтарной кислотой в качестве стабилизирующего и восстанавливающего агента, используемой в процессе синтеза (для гомогенных систем определения железа); • наночастицы с таниновой кислотой в качестве восстанавливающего и стабилизирующего агента (для каталитических систем определения ионов свинца). Принцип гомогенного агрегационного анализа основан на взаимодействии модифицированных наночастиц с определяемым аналитом в гомогенной среде, протекающем со сближением наночастиц, потерей их агрегационной и седиментационной устойчивости вследствие формирования крупных кластеров, и в конечном счете агрегацией. Для понимания закономерностей протекания взаимодействия в гомогенном анализе проведено математическое моделирование с помощью программного пакета COPASI и проведено сравнение с экспериментальными данными. Получены и охарактеризованы препараты наночастиц золота с таниновой кислотой и меркаптоянтарной кислотой, использованные в гомогенном анализе. Разработаны гомогенные колориметрические системы для определения ионов тяжелых металлов (Hg2+ и Cd2+, Fe3+, Pb2+), при этом специфичность взаимодействия определяется выбранной рецепторной молекулой, иммобилизованной на поверхности золотой наночастицы, либо используемой в качестве восстанавливающего и стабилизирующего агента при синтезе наночастиц. Иммобилизация меркаптоянтарной кислоты на поверхности золотых наночастиц позволила фотометрически детектировать ионы ртути и кадмия при концентрациях 21,5 нг/мл и 12,1 нг/мл, соответственно. Применение конъюгата наночастицы-меркаптоянтарная кислота показало возможность обнаружения ионов железа до 10 нг/мл. Продемонстрировано использование таниновой кислоты в каталитической системе определения ионов свинца до 3,2 нг/мл, где для визуальной оценки каталитической активности наночастиц золота использовали тетраметилбензидин. Для гетерогенного формата анализа (иммунохроматография) получены комплексы белка БСА с аминофенилфборной кислотой (АФБК) и глутатионом. Показано применение иммунохроматографической системы с использованием конъюгата БСА-АФБК и конъюгата золотых наночастиц с поли-С олигонуклеотидной последовательностью для инструментального определения ионов Pb2+ в концентрациях до 0,05 нг/мл и визуального - до 1 нг/мл, рабочий диапазон определяемых концентраций составил 0,1 – 5 нг/мл. Время анализа составило 5 мин. Применение конъюгата БСА-глутатион обеспечило прямую зависимость аналитического сигнала от содержания ионов, обусловленную накоплением комплексов металл-олигонуклеотид-наночастица. Проведенная совместно с индийской стороной работа по электрохимическому определению ионов свинца продемонстрировала возможности использования биметаллических частиц состава Ag-Au, конъюгированных с гуанин-, тимин-обогащенным аптамером. Система апробирована на пробах воды, отобранной в северной Индии, показав возможность детекции ионов свинца в диапазоне концентраций 0,01–10 мкг/л.

 

Публикации

1. Берлина А.Н., Сотников Д.В., Комова Н.С., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Limitations for colorimetric aggregation assay of metal ions and ways of their overcoming Analytical Methods, - (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1039/D0AY02068K

2. Морячков Р.В., Заблуда В.Н., Берлина А.Н., Питерс Г.С., Кичкайло А.С., Соколов А.Е. Small-angle scattering applications to the analysis of aptamer structure and conformational changes AIP Conference Proceedings, v. 2299, article 040002 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1063/5.0030394

3. Сотников Д.В, Берлина А.Н., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Theoretical limitations for aggregation methods of analysis based on affine interactions AIP Conference Proceedings, - (год публикации - 2021)

4. Ядав Р., Берлина А.Н., Жердев А.В., Гаур М.С., Дзантиев Б.Б. Rapid and selective electrochemical detection of Pb2+ ions using aptamer-conjugated alloy nanoparticles SN Applied Sciences, v. 2, article 2077 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1007/s42452-020-03840-6

5. Берлина А.Н., Комова А.Н., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Lateral flow test strips for mercury ions detection based on combination of oligonucleotide-modified gold nanoparticles and chelation by glutathione Тезисы IV Международной научно-практической конференции «Современные синтетические методологии для создания лекарственных препаратов и функциональных материалов» (MOSM 2020). 16-20 ноября 2020 г., Екатеринбург., DR-3 (год публикации - 2020)

6. Берлина А.Н., Комова Н.С., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Экспрессные методы бесприборной детекции тяжелых металлов, основанные на использовании комплексов наночастиц золота с олигонуклеотидами Материалы форума «Биотехнология: Состояние и перспективы развития. Международный форум». Москва, 28-30 октября 2020 г., Выпуск 18, С. 306-307 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.37747/2312-640X-2020-18

7. Берлина А.Н., Комова Н.С., Серебренникова К.В., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Rapid colorimetric nanoparticles aggreration test for monitoring mercury and cadmium ions in water sources Vth International Conference “Actual Scientific & Technical Issues of Chemical Safety” (ASTICS-2020). Kazan, October 6 – 8, 2020. Book of Abstracts, P. 60 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.25514/CHS.2020.05.7755

8. Берлина А.Н., Комова Н.С., Серебренникова К.В., Жердев А.В., Дзантиев Б.Б. Rapid colorimetric tests for Hg2+ and Cd2+ ions in water samples with the use of thiol-covered gold nanoparticles Proceedings of the 20th International Conference on Heavy Metals in the Environment (ICHMET 2020). October 25-29, 2020. Seoul, Korea, P.108 (год публикации - 2020)