КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 20-74-00093

НазваниеИзучение взаимосвязи структуры и биологической активности природных 10-членных лактонов и их полусинтетических производных

РуководительДалинова Анна Александровна, Кандидат биологических наук

Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Всероссийский научно-исследовательский институт защиты растений", г Санкт-Петербург

Период выполнения при поддержке РНФ 07.2020 - 06.2022 

Конкурс№49 - Конкурс 2020 года «Проведение инициативных исследований молодыми учеными» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными.

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни, 04-209 - Биотехнология (в том числе бионанотехнология)

Ключевые слова10-членные лактоны, ноненолиды, природные соединения, Stagonospora cirsii, биологическая активность, пестициды природного происхождения

Код ГРНТИ62.13.43 62.09.39


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Биологически активные вторичные метаболиты могут служить потенциальными базовыми структурами для действующих веществ пестицидов. Многолетнее применение химических средств защиты растений с однотипными механизмами действия приводит к появлению резистентных популяций сорных растений, вредителей и возбудителей заболеваний. Поэтому в настоящее время крайне востребованы гербициды, фунгициды и инсектициды с новыми механизмами действия. Объектом исследования предлагаемого проекта являются представители 10-членных лактонов (ноненолидов) – группы природных соединений, образуемых преимущественно микромицетами. Эти молекулы привлекают внимание исследователей, так как обладают достаточно простой структурой и при этом проявляют широкий спектр биологической активности - фитотоксической, фунгицидной, цитотоксической и др. Однако большинство описанных в литературе представителей семейства ноненолидов тестировали на 1-2 типа активности, в некоторых случаях экзотичных, например, ингибирование прорастания пыльцы сосны, ингибирование конкретных ферментов. Кроме того, многие ноненолиды были охарактеризованы физико-химическими методами, но их биологическая активность осталась неизученной вследствие крайне низкого выхода этих веществ из культур продуцентов (не более 10 мг/л для большинства представителей семейства). Подобная недостаточная изученность биологической активности большинства известных природных 10-членных лактонов затрудняет использование литературных данных для анализа взаимосвязи структуры и активности. В предыдущих исследованиях нами было показано, что гриб Stagonospora cirsii является «биофабрикой» по производству ноненолидов с разнообразной структурой и биологической активностью – стагонолидов А-К, гербарумина I, модиолида А, курвулида А и пиренолида С. Широкий набор ноненолидов, образуемых S. cirsii, представляет собой ценную библиотеку для анализа взаимосвязи структуры и активности. Кроме того, как минимум восемь ноненолидов при культивировании S. cirsii образуется в биотехнологически значимых количествах, что открывает широкие возможности для получения их полусинтетических производных. Это позволит расширить базу тестируемых соединений, а также верифицировать предполагаемые закономерности взаимосвязи структуры и активности в пределах семейства 10-членных лактонов путем направленной модификации веществ. Благодаря этому, впервые в рамках единого эксперимента при помощи стандартных современных методов будет оценена биологическая активность большой базы ноненолидов (более 15-ти веществ) на широком спектре тест-организмов. По накопленным экспериментальным данным будут сделаны выводы о важности тех или иных заместителей, их пространственного расположения и конфигурации цикла в проявлении конкретных видов биологической активности. Кроме того, наиболее активные вещества впервые будут изучены углубленно (с использованием расширенного спектра тест-организмов и методик тестирования).

Ожидаемые результаты
Поиск перспективных биологически активных веществ, которые могут выступать в качестве базовых структур для новых пестицидов, является одной из приоритетных задач в современной защите растений, как в мировой практике, так и в сельском хозяйстве России. В ходе реализации данного проекта будет охарактеризована биологическая активность широкого набора природных и полусинтетических 10-членных лактонов (ноненолидов), в частности их фитотоксическая, антимикробная, антифунгальная, инсектицидная, цитотоксическая и антирадикальная активности. В результате выполнения проекта будут сформированы гипотезы о взаимосвязи структуры соединений (наличия и положения заместителей, конфигурации) и их биологической активности. В ходе работы по проекту будут выявлены соединения, обладающие перспективной биологической активностью для дальнейшей разработки в качестве возможных действующих веществ пестицидов, в частности, будут подробно охарактеризованы фитотоксичные ноненолиды и их физиологическое действие на различные растительные объекты, оценен спектр и степень антимикробной, антифунгальной и инсектицидной активности наиболее перспективных соединений. Результаты, полученные в ходе выполнения проекта, станут основой для проведения количественного анализа взаимосвязи структуры и активности (QSAR) фитотоксичных, инсектицидных и антимикробных ноненолидов. В ходе исследований по проекту будет сформирована база соединений с различными типами и уровнем активности, а также выявлены биотесты, наиболее точно отражающие различия и диапазон целевой активности соединений. Таким образом, реализация данного проекта будет способствовать построению QSAR-модели с хорошей предсказательной способностью, что невозможно без проведения предварительных исследований, изложенных в плане проекта. Построение подобных моделей хорошо разработано в случае фармакологически активных веществ и действующих веществ пестицидов, в результате выполнения проекта этот подход впервые может быть применен к семейству природных токсинов. Такой прецедент будет способствовать рациональному моделированию пестицидов нового поколения на основе природных соединений. Полученные в ходе проекта результаты будут иметь большое значение в качестве основы для разработки российских действующих веществ пестицидов. Устойчивые к действию наиболее распространенных пестицидов популяции сорных растений, вредителей и возбудителей болезней являются серьезной проблемой в США, странах Европы, Японии, Австралии, следовательно, результаты предлагаемого проекта будут иметь международное значение.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2020 году
Объектом исследования проекта являются представители 10-членных лактонов (ноненолидов) – группы природных соединений, образуемых преимущественно микромицетами. Представители этого обширного семейства вторичных метаболитов грибов различаются длиной алкильной цепи при атоме С-9, наличием и положением двойных связей, гидроксигрупп, карбонильных и эпоксидных групп, конфигурацией заместителей. Из экстрактов гриба Stagonospora cirsii при помощи различных хроматографических методов мы выделили восемь природных 10-членных лактонов - стагонолиды A, E, J, K, гербарумин I, курвулид А и пиренолид С. В качестве характеристики их биологической активности мы оценили их фитотоксичность в отношении надколотых листовых дисков осота полевого, антимикробную активность против Bacillus subtilis, контактную инсектицидную активность в отношении злаковой тли и способность подавлять прорастание конидий фитопатогенных грибов Bipolaris sorokiniana, Alternaria tenuissima, Fusarium culmorum и S. cirsii. Стагонолиды A, J и K, как и гербарумин I показали высокую фитотоксическую активность в опыте на надколотых листовых дисках. Стагонолид Е и курвулид А не проявили активности в данном биотесте. Стагонолид L и пиренолид С продемонстрировали слабую фитотоксическую активность. Среди всех соединений только стагонолиды А, Е и пиренолид С продемонстрировали антимикробную активность. Стагонолид А в концентрации 100 мкг/мл подавлял прорастание конидий всех тест-грибов, в том числе, гриба-продуцента. Стагонолид E на 70% снижал всхожесть конидий F. culmorum, но не оказывал влияния на споры остальных грибов. Остальные соединения не препятствовали прорастанию спор. Только стагонолиды E и J были токсичны для злаковой тли, смертность тлей по сравнению с контролем составила около 60%. Так как фитотоксическая активность природных 10-членных лактонов была выражена в большей степени, чем другие типы активности, в исследованиях первого года проекта мы сосредоточились на анализе взаимосвязи структуры и фитотоксической активности. Фитотоксичные 10-членные лактоны S. cirsii (стагонолиды А, J, K и гербарумин I) различаются заместителями и конфигурацией при С-7 и С-8, а также конфигурацией С-9. Для выявления структурных особенностей, обуславливающих спектр и степень фитотоксической активности этих соединений, мы получили их полусинтетические окисленные и ацетилированные формы. Набор соединений из четырех природных и семи полусинтетических 10-членных лактонов тестировали на фитотоксическую активность в трех биотестах с использованием различных растительных моделей - методом надколотых листовых дисков осота полевого, в отношении проростков салата на водном агаре и против зеленых микроводорослей Hematococcus lacustris. Анализ полученных данных показал, что окисление С-7 гидроксигруппы до карбонильной приводит к резкому повышению фитотоксической активности в отношении надколотых листьев осота и проростков салата, а также к проявлению токсичности в отношении водорослей, бактерий и грибов. Профиль биологической активности в серии биотестов напрямую зависит от механизма действия вещества. Так, три использованных биотеста для определения фитотоксической активности четко показали различия в механизмах действия метрибузина (ингибитора фотосистемы II) и метсульфурон-метила (ингибитора ацетолактатсинтазы). Метрибузин оказался высокотоксичным для зеленых водорослей и листьев осота полевого, в то время как метсульфурон-метил показал высокую фитотоксичность в отношении проростков салата. Таким образом, C-7-окисленные 10-членные лактоны (стагонолид А, ацетилстагонолид А и С-7 окисленный стагонолид К) могут иметь механизм действия отличный от механизма действия остальных фитотоксинов S. cirsii.

 

Публикации


Аннотация результатов, полученных в 2021 году
За второй год выполнения проекта в электронном виде была оформлена база известных природных 10-членных лактонов, которая содержит информацию о 202-х веществах, в том числе их тривиальные названия и характеристики структуры, а также данные об их биологической активности и природных источниках. Реализация базы в виде большой таблицы в формате Excel предоставляет возможность проводить статистическую обработку этой информации, группировать 10-членные лактоны исходя из их структурных особенностей, систематического положения продуцентов, биологической активности. При помощи метода рентгено-структурного анализа была пересмотрена конфигурация стереоцентров в молекуле курвулида А как 4S, 5S, 6R, 9R, что опровергает ранее предложенную в работе (Schmidt, Kunz, 2013) гипотезу о конфигурации атомов эпоксидного цикла. В процессе получения новых полусинтетических производных природных 10-членных лактонов были получены новые данные об особенностях протекания химических реакций с различными представителями класса. При эпоксидировании стагонолида Е, 7,8-диацетилгербарумина I и ацетилстагонолида Е 3-хлорпероксибензойной кислотой (реакция Прилежаева) было продемонстрировано, что итоговая конфигурация эпоксидного цикла объясняется не ориентирующим влиянием соседствующей гидроксильной группы (так называемым «эффектом Хэнбеста»), как было общепринято ранее, а стерическими факторами атаки перекиси на кратную углерод-углеродную связь. В ходе выполнения проекта было показано, что гидрирование 10-членных лактонов с помощью газообразного водорода в присутствии 5%-ного палладия ну угле в среде ТГФ с точки зрения хемоселективности протекало по трем основным направлениям: восстановление кратной С=С связи, изомеризация аллильных спиртов в насыщенные кетоны, раскрытие эпоксидного цикла (если он присутствует в структуре исходной молекулы). В библиотеку веществ для тестирования спектра биологической активности, как и в первый год выполнения проекта, вошли природные и полусинтетические представители класса. Стагонолиды A, J, K и гербарумин I, модифицированные по С-5-С-6 двойной связи (эпокси-производные и гидрированные производные) были интересны в первую очередь с точки зрения взаимосвязи структуры и фитотоксической активности. Производные стагонолида Е и курвулида А, а также разнообразные природные представители класса с метильной группой при С-9 интересны взаимосвязью структуры с инсектицидной, антигрибной и цитотоксической активностью. Суммарное количество 10-членных лактонов, протестированных в широком наборе биотестов за второй год выполнения проекта, составило 18 веществ. Анализ биологической активности библиотеки веществ, полученных во втором году выполнения Проекта, показал, что модификация С-5-С-6 двойной связи приводит к неоднозначным изменениям в фитотоксической активности полусинтетических производных гербарумина I, стагонолидов A и К. Дигидрогербарумин I, в отличие от эпоксигербарумина I, сохранил фитотоксическую активность, хоть она и несколько снизилась по сравнению с природным предшественником. В то же время эпоксистагонолид К, напротив, продемонстрировал фитотоксическую активность, сравнимую с активностью стагонолида К. К сожалению, продукт реакции гидрирования стагонолида К оказался нестабильным, поэтому его не исследовали в биотестах. Продукт гидрирования стагонолида А показал слабую фитотоксическую активность и отсутствие токсичности в остальных биотестах. Возможно, фитотоксическая активность этих веществ зависит от пространственной структуры С-5-С9 участка молекулы. Среди 10-членных лактонов с метильным заместителем при С-9 в нашу библитотеку входили три очень близких по структуре природных соединения, а именно стагонолид Е, его природный эпоксидированный аналог курвулид А, а также структурный изомер курвулида А по положению ОН-группы. Интересно, что каждое из этих веществ проявляет уникальный тип активности, который не свойственен остальным двум соединениям. Так, стагонолид Е токсичен для злаковой тли, курвулид А и его ацетильное производное - фитотоксичны, а новый изомер курвулида А проявляет цитотоксическую активность в отношении клеток Sf9. Помимо ацетильных производных стагонолида Е и курвулида А, в полученном наборе 10-членных лактонов нет других соединений, с которыми можно было бы сравнить биологическую активность этих веществ, чтобы однозначно определить структурные особенности, обуславливающие их инсектицидную, фитотоксическую и цитотоксическую активности. В ходе второго года выполнения Проекта на качественно новом уровне был проведен анализ данных, полученных в прошлом году. Была оценена антимикробная и цитотоксическая активность одиннадцати рассматриваемых за первый год природных и полусинтетических 10-членных лактонов, методом обращенно-фазовой ВЭЖХ определена липофильность (LogP) исследуемых веществ. Полученные данные были проанализированы и визуализированы при помощи метода главных компонент. Наблюдалась высокая корреляция между токсичностью веществ в различных биотестах - в отношении водорослей, бактерий и клеток Sf9. Липофильность веществ показала отрицательную корреляцию с результатами фитотоксичности на листовых высечках осота. Исследуемые вещества разделились на два кластера – в один попали вещества, имеющие кето-группу при С-7, а в другой – все остальные. Результаты изложены нами в публикации Dalinova et al., 2021. Более детальное изучение биологической активности пиренолида С показало, что профиль его токсичности схож с профилем токсичности стагонолида А. В их структурах имеется схожий набор функциональных групп, в частности кето-группа, сопряженная с кратной С-С связью. В первом году выполнения Проекта мы показали, то направленное окисление С-7 гидроксильной группы в молекуле стагонолида К до кето-группы приводит к такому же повышению побочной токсичности. В этом году мы показали, что восстановление С-5-С-6 кратной связи в молекуле стагонолида А ведет к потере побочной токсичности. Из полученных данных следует, что 10-членные лактоны с сопряженной кето-группой будут демонстрировать неспецифическую токсичность. С использованием нескольких физиолого-биохимических тестов мы показали контрастность эффектов стагонолида А и гербарумина I. Очевидно, что два родственных по структуре фитотоксина обладают совершенно разными механизмами действия. Многие природные токсины напрямую оказывают влияние на работу ФСII, например, через связывание с D1-белком (тенуазоновая кислота, патулин) (Chen et al., 2007; Guo et al., 2021). Наши результаты демонстрируют, что механизмы действия стагонолида А и гербарумина I затрагивают другие клеточные процессы в растительных клетках. Токсичность стагонолида А (как и цитологические изменения состояния обработанных тканей) проявляются уже в первые часы после обработки, маловероятно, что они обусловлены действием на биосинтез каких-либо важных компонентов клеток. Одним из вероятных механизмов действия может быть нарушение экспорта белков из эндоплазматического ретикулума (ЭР) и/или комплекса Гольджи, либо нарушение формирования везикул обмена между ЭР и комплекса Гольджи. В случае гербарумина I эффекты развиваются длительное время, поэтому можно предположить влияние на биосинтез пигментов, аминокислот, жирных кислот, компонентов клеточных стенок и т.д. Сходный эффект на OJIP-кинетики наблюдается при воздействии природных фитотоксинов макроцидинов, которые ингибируют биосинтез каротиноидов (Hubbard et al., 2016). К сожалению, полученные в ходе выполнения Проекта результаты пока что не позволяют сузить круг возможных механизмов действия гербарумина I.

 

Публикации

1. Далинова А.А., Федоров А.Н., Дубовик В.Р., Войцеховская О.В., Тютерева Е.В., Смирнов С.Н., Кочура Д.М., Чистый Л.С., Сендерский И.В., Берестецкий А.О. Structure–Activity Relationship of Phytotoxic Natural 10-Membered Lactones and Their Semisynthetic Derivatives Journal of Fungi, V. 7, N.10, 829 (год публикации - 2021) https://doi.org/10.3390/jof7100829


Возможность практического использования результатов
не указано