КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 21-11-00062

НазваниеСтохастическая нелинейная динамика живых систем: модели, явления и методы анализа

РуководительРяшко Лев Борисович, Доктор физико-математических наук

Организация финансирования, регион федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Уральский федеральный университет имени первого Президента России Б.Н. Ельцина", Свердловская обл

Период выполнения при поддержке РНФ 2021 г. - 2023 г. 

Конкурс№55 - Конкурс 2021 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами».

Область знания, основной код классификатора 01 - Математика, информатика и науки о системах, 01-205 - Математические модели в науках о живом

Ключевые словакальциевые осцилляторы, гликолиз, нейродинамика, динамика популяций, эко-эпидемиология, иммуно-опухолевая динамика, пространственно-временная самоорганизация, случайные возмущения, устойчивость, чувствительность, бифуркации, хаос

Код ГРНТИ27.35.43


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Переход от традиционных методов статистической обработки временных рядов к построению и анализу адекватных математических моделей является отличительной чертой современных исследований в науках о живом. Актуальные задачи анализа сложных нелинейных режимов поведения в биологических системах решаются с помощью современной математической теории бифуркаций. Случайные возмущения, неизбежно присутствующие в таких системах, могут существенно изменить сценарии поведения и вызвать явления, причины которых не объясняются в рамках исходных детерминированных моделей. Построение адекватных стохастических моделей и разработка конструктивных методов их анализа является актуальной задачей в современных науках о живом. В цикле последних работ коллектива участников проекта развивается авторский подход, использующий технику стохастической чувствительности и метод доверительных областей, ориентированный на конструктивный параметрический анализ воздействия случайных возмущений на динамические режимы нелинейных систем с непрерывным и дискретным временем. Целью данного проекта является развитие теории и распространение этого нового авторского подхода на анализ внутренних биологических механизмов, порождающих широкий круг индуцированных шумом явлений, недавно обнаруженных в процессах внутри- и межклеточных обменов, нейронной динамике, сердечной активности, динамике популяций и метапопуляций, процессах распространения инфекций, иммуно-опухолевых взаимодействиях. Новизну и особую научную значимость проекта имеет установление общих закономерностей и разработка универсальных методов анализа моделей живых систем, относящихся к разным иерархическим уровням и имеющих различную физическую природу. Математической основой проекта, мотивированного исследованиями стохастических феноменов в живых системах, является разработка аппарата аппроксимации вероятностных распределений в зонах сложных бифуркаций, фрактальных бассейнов и транзиентов, где генерируются мультимодальные осцилляционные регулярные и хаотические режимы, формируются фантомные аттракторы.

Ожидаемые результаты
Круг задач данного проекта охватывает различные уровни живых систем и математические методы их анализа, поэтому является достаточно масштабным. Ожидается, что в ходе выполнения работ будут получены новые научные результаты, представляющие интерес для математиков, биологов, биофизиков и медиков. 1) Моделирование и анализ стохастической кинетики ферментативных реакций. Будут разработаны методы и проведен анализ кинетических особенностей стохастической генерации сложных мультиритмичных регулярных и хаотических режимов в моделях ферментативных реакций с разными типами нелинейных связей, описывающих ингибирование и активацию. Наряду с точечными моделями, будут рассмотрены распределенные модели с диффузией и исследованы эффекты случайных возмущений в процессах пространственно-временной самоорганизации. 2) Стохастическая динамика кальциевых осцилляторов. В проекте будет выявлена вероятностная природа переходов от равновесных к сложным колебательным режимам в связи с локальными и глобальными бифуркациями. Будут исследованы эффекты стохастической возбудимости, канардовских осцилляций, мультимодальности и возможные индуцированные шумами переходы порядок-хаос. 3) Нелинейная стохастическая нейродинамика. Для непрерывных моделей отдельных нейронов, на базе разрабатываемой в проекте теории аппроксимации стохастических аттракторов, будут выявлены механизмы стохастической генерации регулярных и хаотических бёрстовых режимов возбуждения в зонах сложных бифуркаций «катастрофы голубого неба», Неймарка-Сакера, Лукьянова-Шильникова. На базе дискретных нейронных моделей Рулькова, Киалво, Курбажа-Некоркина будет исследована роль транзиентных аттракторов в процессах стохастической генерации бёрстинга в зонах устойчивых равновесий, изучены эффекты случайных воздействий в зонах перехода от квазипериодического спайкинга к хаотическому бёрстингу, выявлен механизм глобальных сдвигов, связанных с появлением фантомных аттракторов. Будут исследованы вызываемые шумами деформации корпоративных режимов в системах связанных нейронов. 4) Стохастическая иммуно-опухолевая динамика в условиях терапии В проекте будет разработана динамическая модель, учитывающая нелинейное взаимодействие иммунных и опухолевых клеток в условиях лечения, использующего химио- и радиотерапию. Будет дано параметрическое описание изменений динамических режимов модели в зависимости от параметров скорости инактивации иммунных клеток опухолевыми и интенсивности химиотерапии, найдены сосуществующие аттракторы, отвечающие режимам «активной» и «спящей» опухоли. Будут исследованы эффекты случайных возмущений в процессах подавления и активации опухоли, найдены оценки дозы химиотерапии, обеспечивающей как удержание в режиме «спящей» опухоли, так и ее полное подавление. 5) Стохастическая кардиодинамика На базе трехмерной модификации модели Люо-Руди сердечного потенциала действия будут исследованы динамические механизмы ранних постдеполяризаций (РПД) в связи со спецификой бифуркаций добавления периода, изолами предельных циклов, циклами-канардами в условиях стохастических флуктуаций. Планируется развитие исследований за счет перехода к четырёхмерной модификации стохастической модели Люо-Руди, учитывающей как процесс инактивации, так и более быструю динамику активации токов кальция в мембране кардиомиоцита с другим бифуркационным механизмом возникновения колебаний с РПД. 6) Стохастическая популяционная динамика В проекте будут исследованы стохастические деформации режимов функционирования в моделях сложных иерархически связанных популяций, учитывающих структурирование по типу трофических связей, внутри- и межвидовых отношений. Здесь исключительно важным, в нынешних условиях развивающейся пандемии коронавируса, представляется направление по исследованию факторов, определяющих различные эпидемиологические сценарии распространения инфекций. На базе дискретных и непрерывных динамических моделей с параметрами, отражающими скорость передачи инфекции в зависимости от интенсивности контактов между здоровыми и инфицированными, смертности инфицированных и показателя выздоравливаемости, будет исследована вариативность динамики инфекции, связанная с мультистабильностью, наличием регулярных и хаотических осцилляционных режимов, индуцированных шумами переходов. Планируется исследование стохастических факторов, влияющих на динамику растительного покрова планеты, в связи с глобальными климатическими изменениями на базе нелинейной модели Гиля «климат-вегетация». С помощью разрабатываемой в проекте теории фантомных аттракторов, будут описаны вероятностные механизмы систематических сдвигов глобальной температуры как в сторону увеличения («потепление»), так и в сторону уменьшения («замораживание»), и связанных с ними изменения площади Земли, покрытой растительностью. В области стохастической динамики метапопуляций будут получены параметрические описания процессов синхронизации и десинхронизации в моделях с разными типами и интенсивностями взаимных перетоков, а также трансформаций порядок-хаос. Будут разработаны методы анализа этих явлений, учитывающие специфику транзиентных аттракторов и бассейнов притяжения с фрактальной структурой. 7) Развитие математической теории и методов стохастического анализа Для решения задач математического моделирования рассматриваемых в проекте явлений в живых системах разных иерархических уровней предполагается разработка новых методов стохастического анализа, алгоритмов и программ. Предлагамая теория позволит охватить широкий круг стохастических феноменов, связанными с пространственными регулярными и хаотическими аттракторами, сложными бифуркациями типа «катастрофы голубого неба», Неймарка-Сакера, Лукьянова-Шильникова. Здесь планируется построение методов анализа стохастической возбудимости, связанной с транзиентными и фантомными аттракторами в непрерывных и дискретных моделях. Будет построена теория и конструктивные алгоритмы для расчета стохастической чувствительности пространственных паттернов-аттракторов распределенных моделей. Важным направлением является построение методов моделирования и анализа систем с биологически мотивированными цветными шумами и импульсными случайными воздействиями в форме полетов Леви. На основе разрабатываемых методов стохастического анализа планируется построение методов управления, ориентированных на актуальные, социально значимые задачи предотвращения экологических сдвигов и катастроф, сдерживания эпидемий, подавления роста опухолей. Такой диапазон систем разной биологической природы продиктован желанием авторов выявить те общие закономерности, которые скрываются за разнообразием явлений и их моделей. Ожидаемые результаты проекта имеют принципиальную значимость для существенного продвижения в понимании общих стохастических механизмов поведения живых систем различной физико-химической природы и относящихся к различным иерархическим уровням. Выявление этих общих механизмов поведения позволяет строить в проекте универсальные методы их анализа. В то же время эти результаты исследований позволят найти новые идеи для изучения сложного нелинейного поведения живых систем. Проект с такой широтой охвата различных явлений в нелинейных моделях биологических систем и методов их исследования является важным шагом, отвечающим насущным запросам современного математического моделирования в науках о живом. Заявленные результаты соответствуют мировому научному уровню и дают новый взгляд на современное представление о природе, структуре и закономерностях явлений в науках о живом и методы их анализа. Разрабатываемая в проекте математическая теория нелинейных стохастических явлений и новые конструктивные методы прогнозирования поведения сложных биологических систем могут быть использованы при решении конкретных задач в экономике и социальной сфере. Результаты проекта будут опубликованы в ведущих высокорейтинговых российских и международных научных журналах. Важным приложением результатов проекта является разработка учебных курсов для подготовки кадров высшей квалификации, способных решать стоящие перед обществом современные научно-технические и социальные задачи.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2021 году
1) Для двумерной модели Голдбетера энзимной кинетики с нелинейной рециркуляцией продукта в субстрат выявлен механизм индуцированной шумом генерации большеамплитудных стохастических осцилляций в зоне устойчивых равновесий и стохастических переходов в зоне сосуществующих равновесных и автоколебательных аттракторов. В зоне моностабильности обнаружена связь явления стохастического возбуждения с наличием у детерминированной модели так называемых транзиентных осцилляционных аттракторов. В зоне бистабильности обнаружено явление стохастической генерации колебаний смешанных мод. Для этих явлений получено параметрическое описание статистик межспайковых интервалов, плотностей вероятностных распределений и соответствующих P-бифуркаций. Для аналитического описания этих явлений эффективно применен метод доверительных областей. 2) Для распределенного варианта модели Селькова гликолитической реакции выявлено и статистически описано явление мультистабильности и проведен параметрический анализ формирования паттернов и индуцированных шумами многоступенчатых переходов с использованием аппарата гармонических коэффициентов. 3) Для модели Ли-Ринцеля кальциевых колебаний получена классификация режимов динамики, описаны локальные и глобальные бифуркации, выявлены параметрические зоны равновесных и осцилляционных режимов. Для стохастического варианта модели дано вероятностное описание частотных и амплитудных характеристик кальциевых осцилляций. В зоне сосуществования равновесных и автоколебательных режимов обнаружено и исследовано явление предпочтения (“preference”) в процессах индуцированных шумами переходов между ними. 4) Для нейронной двумерной модели Рулькова с разрывным отображением выявлен вероятностный механизм многоступенчатых переходов между сосуществующими циклами разных периодов под действием шума. Построено статистическое описание характеристик таких переходов и доминант в их направленности. На основе аппарата стохастической чувствительности и доверительных эллипсов получены оценки критических интенсивностей шума, вызывающего переходы из бассейна одного осцилляционного аттрактора в другой. 5) Для стохастической дискретной нейронной модели Киалво дано параметрическое описание равновесных и осцилляционных режимов в зависимости от изменения параметра силы ионного тока, локализованы бифуркации жесткого (седлоузловая) и мягкого (Неймарка-Сакера) рождения квазипериодических осцилляций. Показан переход от квазигармонических колебаний к осцилляциям спайкового типа. Для зоны бистабильности дано описание процесса возбуждения и подавления спайковых осцилляций, связанного с индуцированными шумами переходами между равновесными и квазипериодическими аттракторами. 6) Для трёхмерной модели Хиндмарш-Роуз с бифуркацией Лукьянова-Шильникова исследованы стохастические деформации спайковых и берстовых осцилляционных режимов нейронной активности с помощью развиваемой в проекте техники функций стохастической чувствительности, метрики Махаланобиса, аппарата псевдосепаратрис и доверительных областей. Обнаружено и исследовано явление когерентного резонанса и индуцированных шумом переходов от порядка к хаосу. 7) Построена и исследована динамическая модель, учитывающая нелинейное взаимодействие иммунных и опухолевых клеток в условиях химиотерапиии случайных возмущений. Были описаны параметрические зоны моно-, би- и три-стабильности и найдены оценки дозы химиотерапии, обеспечивающей как удержание системы в режиме «спящей» опухоли, так и ее полное подавление. Выявлены условия, при которых случайные возмущения играют позитивную роль, подавляя опухоль, и негативную роль, вызывая ее рост. Была построена и исследована модель, учитывающая важный фактор негативного воздействия химиотерапии на здоровые клетки. 8) Для иерархической модели трех взаимодействующих популяций «жертва-хищник-топ хищник» получены сравнительные оценки условий стохастического возбуждения при разных типах мультипликативных шумов. Дано параметрическое описание переходов от порядка к хаосу и исследован феномен многоступенчатого последовательного вымирания популяций. 9) Для трехмерной эко-эпидемиологической модели взаимодействия популяций «хищник-жертва» с учетом Олли эффекта получено описание бифуркационных сценариев с зонами би- и полиритмичности и сосуществованием регулярных и хаотических аттракторов. Выявлены предпочтительные (преференсные) режимы, возникающие в присутствии случайных помех. Получены оценки критических значений интенсивности случайных возмущений, вызывающих вымирание популяции. 10) Для системы двух популяций, связанных взаимной миграцией, получено параметрическое описание вариативности динамики, связанной с формированием циклов различных периодов, квазипериодических и хаотических осцилляции. Для стохастического варианта этой метапопуляционной модели исследованы феномены раззрушения антифазной синхронизации, стохастического подавления колебаний со стабилизацией неустойчивого равновесия, вымирания популяций, индуцированного шумом перехода к хаосу. Выявлена важная роль транзиентных хаотических аттракторов и фрактальной структуры бассейнов притяжения. 11) На базе нелинейной динамической модели "климат-вегетация" выявлены вероятностные механизмы вызываемых шумами систематических сдвигов глобальной температуры. Показано, что аддитивный шум увеличивает, а мультипликативный шум снижает температуру вплоть до замерзания. Для объяснения вероятностного механизма этого явления была развита теория фантомных аттракторов, использующая технику замораживания медленной переменной и усреднения по быстрой. 12) Для трехмерной модификации стохастического варианта модели Люо-Руди сердечного потенциала действия в области равновесных режимов получено параметрическое описание статистических характеристик генерируемых шумом колебаний. Обнаружены и исследованы феномены когерентного резонанса стохастических колебаний с ранней постдеполяризацией (РПД), а также их подавление шумом. 13) Разработан математический аппарат, построены алгоритмы и созданы программы, позволяющие проводить конструктивный параметрический анализ новых стохастических феноменов, связанных с пространственными регулярными и хаотическими аттракторами в следующих трехмерных моделях: модели Голдбетера энзимной реакции, нейронной модели Хиндмарш-Роуз, популяционной модели жертва-два хищника, эко-эпидемиологической модели и модели ранней деполяризации в сердечной активности. Развита теория фантомных аттракторов в стохастических быстро-медленных системах с привлечением метода замораживания медленной переменной и усреднения быстрой. 14) Разработаны конструктивные алгоритмы для нахождения внешних границ хаотических аттракторов двумерных систем с дискретным временем, основанные на геометрическом отборе точек критических линий, принадлежащих только внешней границе. Решена задача описания доверительных областей вокруг хаотических аттракторов стохастических систем. 15) Для стохастических распределенных диффузионных моделей развита теория и построены конструктивные алгоритмы по параметрическому описанию и анализу стохастической чувствительности паттернов-аттракторов, генерируемых в зоне неустойчивости Тьюринга. Построенная теория эффективно применена к сравнительному анализу реакции паттернов на случайные возмущения в планктонной модели Левина-Сегеля.

 

Публикации

1. Башкирцева И.А., Зайцева С.С. Variability, transients and excitement in a stochastic model of enzyme kinetics Chaos, Solitons and Fractals, V. 150, P. 111184 (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1016/j.chaos.2021.111184

2. Башкирцева И.А., Колиниченко А.П., Ряшко Л.Б. Stochastic sensitivity of Turing patterns: methods and applications to the analysis of noise-induced transitions Chaos, Solitons and Fractals, V.153, p.111491 (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1016/j.chaos.2021.111491

3. Башкирцева И.А., Перевалова Т.В., Ряшко Л.Б. Stochastic Effects in the Eco-epidemiological Model with Multirhythmicity AIP Conference Proceedings, - (год публикации - 2021)

4. Башкирцева И.А., Перевалова Т.В., Ряшко Л.Б. A stochastic hierarchical population system: excitement, extinction and transition to chaos International Journal of Bifurcation and Chaos, V. 31, N. 14, P. 2130043 (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1142/S0218127421300433

5. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б., Дуарте Х., Сеоане Х.М., Санхуан М. А. Ф. The role of noise in the tumor dynamics under chemotherapy treatment The European Physical Journal Plus, V. 136, Article number 1123 (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1140/epjp/s13360-021-02061-z

6. Башкирцева И.А., Цветков И.Н. Noise-Induced Excitement and Mixed-Mode Oscillatory Regimes in the Chialvo Model of Neural Activity AIP Conference Proceedings, - (год публикации - 2021)

7. Башкирцева И.А., Чухарева А.А, Ряшко Л.Б. Modeling and analysis of nonlinear tumor-immune interaction under chemotherapy and radiotherapy Mathematical Methods in the Applied Sciences, опубликована онлайн (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1002/mma.7706

8. Беляев А.В., Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б. Stochastic variability of regular and chaotic dynamics in 2D metapopulation model Chaos, Solitons & Fractals, V. 151, P. 111270 (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1016/j.chaos.2021.111270

9. Перевалова Т.В., Сатов А.В. Numerical Methods for Stochastic Sensitivity Analysis of 2D Chaotic Attractors AIP Conference Proceedings, - (год публикации - 2021)

10. Ряшко Л.Б., Александров Д.В., Башкирцева И.А. Analysis of stochastic generation and shifts of phantom attractors in a climate–vegetation dynamical model Mathematics, V. 9, P. 1329 (год публикации - 2021) https://doi.org/10.3390/math9121329

11. Ряшко Л.Б., Башкирцева И.А., Соловьева О.Э. Stochastic dynamics in the Li–Rinzel calcium oscillation model Mathematical Methods in the Applied Sciences, опубликована онлайн (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1002/mma.7675

12. Слепухина Е.С., Башкирцева И.А., Кюглер Ф., Ряшко Л.Б. Stochastic generation and suppression of early afterdepolarizations in a three-dimensional model of cardiac action potential Mathematical Methods in the Applied Sciences, опубликована онлайн (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1002/mma.7688

13. Слепухина Е.С., Ряшко Л.Б. Stochastic Generation of Bursting Oscillations in the Spiking Region of a 3D Neuron Model with the Lukyanov-Shilnikov Bifurcation AIP Conference Proceedings, - (год публикации - 2021)

14. Цветков И.Н., Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б. Stochastic transformations of multi-rhythmic dynamics and order–chaos transitions in a discrete 2D model Chaos, V. 31, P. 063121 (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1063/5.0054679

15. Башкирцева Ирина Адольфовна, Перевалова Татьяна Владимировна Компьютерный анализ регулярной и хаотической динамики эпидемиологической популяционной модели (Com_Anal_RegChaot_Din_EPM) -, № 2021661912 (год публикации - )

16. Белохохлов Олег Валерьевич, Перевалова Татьяна Владимировна Компьютерное моделирование и анализ модели «хищник-жертва» с Олли эффектом (ComAn_Mod_PPM_wAE) -, №2021661911 (год публикации - )


Аннотация результатов, полученных в 2022 году
1) Для двумерной модели ферментативной реакции выявлен механизм стохастической генерации фантомного аттрактора, порождающей под действием мультипликативных шумов систематический сдвиг вероятностных распределений в зону, где невозмущенная детерминированная модель не имеет никаких аттракторов. На основе развитой теории «замораживания и усреднения» получено параметрическое описание этих сдвигов. Дано аналитическое описание фантомного аттрактора для более сложной модели, учитывающей нелинейную рециркуляцию продукта в субстрат. 2) Для трехмерной модели ферментативной реакции, учитывающей взаимодействие субстрата и двух продуктов, дано параметрическое описание зон мультистабильности с периодическими и хаотическими аттракторами. Исследован механизм стохастической генерации пачечных осцилляций со сложной геометрией. Проведен амплитудно-частотный анализ этих осцилляций с привлечением статистик интербёрстовых интервалов. Выявлена роль транзиентных аттракторов в формировании геометрических свойств новых пачечных осцилляций, обнаружено и исследовано явление перемежаемости зон пачечных и регулярных осцилляций. Получено параметрическое описание переходов между порядком и хаосом. 3) На базе диффузионного варианта концептуальной гликолитической модели Селькова было получено параметрическое описание явления стохастической генерации пространственно-неоднородных паттернов в зоне Тьюринговской устойчивости, где детерминированная модель демонстрирует только гомогенное равновесие. Для анализа разнообразия пространственных форм генерируемых паттернов были разработаны новые статистические характеристики, позволившие выявить доминирующие структуры в стохастическом потоке и рассчитать относительное время их существования. 4) Для модели Ли-Ринцеля кальциевых колебаний с частотной модуляцией локализованы зоны глобальных бифуркаций в зависимости от параметра концентрации инозитолтрифосфата (IP3). Получено описание сценариев стохастической возбудимости, проведен их параметрический анализ с помощью статистик (среднее, коэффициент вариации) межспайковых интервалов. Даны оценки интенсивности шума, вызывающего возбуждение кальциевых осцилляций, в том числе наиболее когерентных. Выявлена особая роль устойчивых многообразий седловых равновесий как сепаратрис, разделяющих до- и надпороговые зоны в процессе стохастического возбуждения. Применительно к анализу кальциевых осцилляций развит и применен аналитический метод стохастической чувствительности и техника доверительных областей. 5) Для нейронной двумерной модели Рулькова, задаваемой дискретным разрывным отображением, получено параметрическое описание явления фантомного аттрактора. Выявлена зависимость направления и величины сдвига такого аттрактора от интенсивности случайных возмущений. Впервые для дискретных систем получено теоретическое обоснование этого феномена с использованием развитой математической техники замораживания и усреднения. 6) Для дискретной нейронной модели Киалво со случайными возмущениями проведен параметрический анализ и выявлены механизмы стохастической возбудимости осцилляций спайкового типа. Разработан метод оценивания критических интенсивностей шумов, вызывающих генерацию осцилляций смешанных мод, на основе анализа взаимного расположения сепаратрис (псевдосепаратрис) и доверительных эллипсов. Дано параметрическое описание трансформаций порядок-хаос-порядок при изменении силы ионного тока и интенсивности случайных возмущений. 7) Для модели Хиндмарш-Роуз нейронной активности получено параметрическое описание индуцированных шумом переходов в зоне биритмичности с сосуществующими пачечными предельными циклами с разным количеством спайков в бёрсте. Выявлены участки предельных циклов, на которых такие переходы наиболее вероятны, получены оценки соответствующих критических интенсивностей шума. Исследованы переходы от порядка к хаосу. С помощью метрики Махаланобиса локализованы критические участки предельных циклов, где стохастические переходы наиболее вероятны. 8) На основе модели динамического взаимодействия иммунных и опухолевых клеток выявлены характерные сценарии результатов воздействия случайных возмущений на поведение системы в условиях химио- и радиотерапии. Для зон моно-, би- и три-стабильности дано параметрическое описание стохастических переходов между равновесными и осцилляционными режимами опухолево-иммунной динамики. Выявлена роль транзиентных полуаттракторов в анализе механизмов стохастических переходов, параметрически описана зона, где случайные возмущения подавляют популяцию опухолевых клеток. 9) Для трехмерной иерархической популяционной модели Базыкина-Апониных проведен бифуркационный анализ, описаны параметрические зоны сосуществования равновесных, регулярных и хаотических осцилляционных режимов. Выявлены механизмы многоэтапных стохастических переходов между режимами, порождающих колебания смешанных мод и вымирание популяций. Выявлены условия, при которых случайные возмущения могут перевести систему в хаотический режим. 10) Для трехмерной эпидемиологической модели «хищник-жертва», в которой популяция хищников подвержена инфекции, описаны стохастические переходы между сосуществующими равновесными и осцилляционными режимами. С использованием аппарата функции стохастической чувствительности проведен анализ чувствительности аттракторов системы к вносимым случайным возмущениям и выявлены условия, при которых шум играет положительную роль в оздоровлении популяции. 11) Получено параметрическое описание вариативности режимов стохастической корпоративной динамики в метапопуляциях, где локальные подсистемы находятся как в одинаковых, так и различных динамических режимах (равновесных, осцилляционных, хаотических). Для случая метапопуляции, состоящей из равновесных и хаотических подсистем, детально исследованы возможные локальные и глобальные бифуркации, дана классификация возможных динамических режимов с моно- и бистабильностью. Выявлена особая роль фрактальных бассейнов, взаимное расположение границ которых с доверительными областями позволяет оценить интенсивность шума, приводящего к критическим явлениям. 12) Для дискретной модели, учитывающей нелинейное взаимодействие здоровой и инфицированной частей популяции, выявлены и локализованы зоны мультистабильности, построены бассейны притяжения аттракторов, отвечающих режимам выздоровления, вымирания и динамического баланса. Выявлена роль сложных транзиентов в описании динамики системы на конечных отрезках времени. Получено описание возможных новых эффектов в расширенной стохастической модели и выявлены вероятностные механизмы индуцированных шумами переходов между сосуществующими динамическими режимами. 13) Для трехмерной модели Люо-Руди сердечного потенциала действия дано параметрическое описание результатов воздействия случайных возмущений на малоамплитудные предельные циклы в зоне циклов-канардов и локализован цикл-канард с максимальной чувствительностью. С использованием метрики Махаланобиса и доверительных областей выявлен механизм стохастического расщепления осцилляций, сигнализирующего об усложнении осцилляторной активности сердца. 14) Развиты новые разделы теории по стохастическому анализу трехмерных динамических систем со сложными осцилляционными аттракторами с использованием аппарата доверительных областей и метрики Махаланобиса. Получила развитие теория фантомных аттракторов в дискретных и непрерывных стохастических системах. Развита теория стохастической чувствительности пространственных негомогенных паттернов диффузионных систем и на ее основе разработаны конструктивные алгоритмы анализа переходов между сосуществующими аттракторами. Разработаны методы анализа механизмов стохастических переходов в системах с транзиентными аттракторами и фрактальными бассейнами с приложением к дискретным динамическим моделям.

 

Публикации

1. Башкирцева И.А., Панкратов А.А. Selkov glycolytic model with diffusion: Patterns, multistability, and stochastic transitions Mathematical Methods in the Applied Sciences, 45, 13, 8142-8150 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1002/mma.8083

2. Башкирцева И.А., Панкратов А.А., Ряшко Л.Б. Noise-induced formation of heterogeneous patterns in the Turing stability zones of diffusion systems Journal of Physics: Condensed Matter, 34, 44, 444001 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1088/1361-648X/ac8c77

3. Башкирцева И.А., Перевалова Т.В. Analysis of stochastic bifurcations in the eco-epidemiological oscillatory model with weak Allee effect International Journal of Bifurcation and Chaos, 32, 08, 2250124 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1142/S0218127422501243

4. Башкирцева И.А., Перевалова Т.В., Ряшко Л.Б. Regular and chaotic variability caused by random disturbances in a predator–prey system with disease in predator Chaos, Solitons & Fractals, 163, 112551 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1016/j.chaos.2022.112551

5. Башкирцева И.А., Перевалова Т.В., Ряшко Л.Б. Метод стохастической чувствительности в анализе динамических трансформаций в модели ”две жертвы-хищник” Компьютерные исследования и моделирование, 14, 6 (год публикации - 2022)

6. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б. Stochastic generation and shifts of phantom attractors in the 2D Rulkov model Chaos, Solitons & Fractals, 159, 112111 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1016/j.chaos.2022.112111

7. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б. How noise can generate calcium spike-type oscillations in deterministic equilibrium modes Physical Review E, 105, 5, 054404 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1103/PhysRevE.105.054404

8. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б. Slow–fast oscillatory dynamics and phantom attractors in stochastic modeling of biochemical reactions Chaos, 32, 3, 033126 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1063/5.0084656

9. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б. Analysis of stochastic dynamics in a multistable logistic-type epidemiological model The European Physical Journal Special Topics, https://doi.org/10.1140/epjs/s11734-022-00618-2 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1140/epjs/s11734-022-00618-2

10. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б., Юзед Х., Сеоан Х.М., Санхуан М.А.Ф. Noise-induced complex dynamics and synchronization in the map-based Chialvo neuron model Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulation, 116, 106867 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1016/j.cnsns.2022.106867

11. Башкирцева И.А., Степанова А.А., Цветков И.Н. Stochastic calcium oscillations in the dynamical Li-Rinzel model AIP Conference Proceedings, 2466, 1, 090028 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1063/5.0089387

12. Беляев А.В., Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б. Noise-Induced transformations in a system of two coupled equilibrium and chaotic subpopulations International Journal of Bifurcation and Chaos, 32, 14, 2250220 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1142/S0218127422502200

13. Колиниченко А.П., Ряшко Л.Б. Stochastic sensitivity analysis of patterns in population dynamics models AIP Conference Proceedings, 2466, 1, 070008 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1063/5.0088651

14. Панкратов А.А., Башкирцева И.А. Stochastic effects in pattern generation processes for the Selkov glycolytic model with diffusion AIP Conference Proceedings, 2466, 1, 090018 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1063/5.0088751

15. Ряшко Л.Б. Noise-induced multirhythmicity, bursting, and order–chaos transitions in the 3D Goldbeter system International Journal of Bifurcation and Chaos, 32, 10, 2250157 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1142/S0218127422501577

16. Слепухина Е.С., Башкирцева И.А., Кюглер Ф., Ряшко Л.Б. Noise-induced triggering and suppression of EADs in a 3D model of cardiac activity AIP Conference Proceedings, 2466, 1, 090021 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1063/5.0088949

17. Слепухина Е.С., Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б., Кюглер Ф. Stochastic mixed-mode oscillations in the canards region of a cardiac action potential model Chaos, Solitons & Fractals, 164, 112640 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1016/j.chaos.2022.112640

18. Слепухина Е.С., Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б., Кюглер Ф. How noise transforms spiking into bursting in a neuron model having the Lukyanov–Shilnikov bifurcation Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulation, 118, 106992 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1016/j.cnsns.2022.106992

19. Чухарева А.А., Башкирцева И.А. Analysis of dynamic regimes of a stochastic tumor-immune model under chemotherapy AIP Conference Proceedings, 2466, 1, 090006 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1063/5.0089390

20. Слепухина Е.С., Ряшко Л.Б. Индуцированные шумом переходы между пачечными предельными циклами в модели нейрона Хиндмарш-Роуз материалы Международной конференции. ИММ УрО РАН; ООО "Издательство УМЦ УПИ", Екатеринбург, 186-191 (год публикации - 2022)

21. Беляев А.В., Башкирцева И.А. Детерминированная динамика модели метапопуляции Рикера -, № 2022616577 (год публикации - )

22. Колиниченко Александр Павлович, Ряшко Лев Борисович Анализ динамики распределенных моделей -, № 2022614148 (год публикации - )

23. Панкратов Александр Андреевич, Башкирцева Ирина Адольфовна Моделирование процессов гликолиза в системах с диффузией -, № 2022616153 (год публикации - )

24. Перевалова Татьяна Владимировна, Башкирцева Ирина Адольфовна Компьютерное моделирование стохастических эффектов в модели эпидемиологии с инфекцией в популяции хищников (Comp_Model_Stoch_Phen_PSI) -, № 2022660880 (год публикации - )

25. - Ученые построили модель распространения инфекций Поиск, https://poisknews.ru/themes/matematika/uchenye-postroili-model-rasprostraneniya-infekczij-ona-podhodit-i-dlya-koronavirusa-i-dlya-ospy-obezyan/?utm_source=yxnews&utm_medium=desktop (год публикации - )

26. - Ученые построили матмодель распространения инфекций УрФУ, Новости университета, https://urfu.ru/ru/news/43055/ (год публикации - )


Аннотация результатов, полученных в 2023 году
1) Для трехмерной модели Голдбетера ферментативной реакции выявлена параметрическая зона сосуществования предельных циклов разных амплитуд и частот. Развита техника стохастической чувствительности многомерных осцилляторных аттракторов и метод главных направлений. С помощью этой теории и разработанных конструктивных алгоритмов выявлен вероятностный механизм генерации шумом тороидальных мультиритмичных колебаний и переходов от порядка к хаосу. Исследована связь феномена вызванной шумом генерации тороидальных колебаний и стохастических Р-бифуркаций. 2) Для пространственно-распределенной модели Селькова-Строгаца выявлены условия, при которых диффузия подавляет гликолитические гомогенные автоколебания и формирует негомогенные стационарные паттерны – аттракторы. Получено параметрическое описание амплитудных и пространственных характеристик формируемых стационарных паттернов. Проведен статистический анализ разнообразия паттернов с привлечением аппарата гармонических коэффициентов и энтропии Шеннона, получены параметрические карты мультистабильности. 3) Для распределенного варианта диффузионной гликолитической модели Селькова-Строгаца в двумерной пространственной области исследованы процессы формирования паттернов. Получено параметрическое описание переходных процессов, мультистабильности, геометрического разнообразия и основных характеристик формируемых паттернов. 4) На базе модели Ли-Ринцеля выявлены условия, при которых кальциевые осцилляции возникают в результате жесткой бифуркации рождения цикла. Локализована параметрическая зона бистабильности с сосуществованием равновесного и автоколебательного режимов. В результате проведенных исследований выявлен вероятностный механизм стохастических трансформаций кальциевых релаксационных автоколебаний и дано параметрическое описание статистик спайковых осцилляций. 5) Для трёхмерной модели нейрона Морриса-Лекара-Термана построена детальная бифуркационная диаграмма и локализованы зоны спайкинга (тонического и амплитудно-модулированного) и бёрстинга. Дана оценка бифуркационного значения, отвечающего рождению торов-канардов. Выявлены механизмы стохастической генерации бёрстовых колебаний тороидального типа в зоне тонического спайкинга. Найдены зависимости вероятности этого феномена от интенсивности случайных возмущений, исследовано явление когерентного резонанса. 6) Для нейронной модели, задаваемой двумерным дискретным отображением Рулькова, найдена параметрическая зона, в которой возможны динамические режимы, сочетающие медленную регулярную фазу и активную фазу бёрстов треугольного и трапецеидального вида. С помощью метода критических кривых локализована зона фазовой плоскости, где происходят трансформации треугольного бёрста в трапецеидальный. Для стохастической системы обнаружен эффект расщепления тонических спайков с генерацией колебаний смешанных мод. Выявлен геометрический механизм индуцированной шумом трансформации треугольного бёрстинга в бимодальный с трапецеидальными фазами. Получено параметрическое описание статистик межспайковых и межбёрстовых интервалов, локализованы зоны когерентного и антикогерентного резонанса. 7) Для системы двух нейронов, задаваемых дискретным отображением Рулькова и однонаправленно связанных через химический синапс, получено описание возможных режимов совместной динамики при вариации трех управляющих параметров: параметра, отвечающего за тип динамического поведения изолированного нейрона, параметра силы связи, а также интенсивности случайных возмущений. Локализованы параметрические зоны с различными сценариями трансформаций динамики от устойчивого равновесия до хаоса, включая моно-, би- и тристабильность, переходы порядок-хаос и наоборот, сосуществование софазных и противофазных режимов синхронизации. Получены статистические характеристики длительности интервалов синхронизации при переходах от софазного к противофазному режиму. 8) На базе трехмерной математической модели динамического взаимодействия опухолевых, иммунных и здоровых клеток, получено параметрическое описание бифуркаций и динамических режимов в зависимости от параметра активности иммунной системы и от интенсивности терапии. Дан обзор характерных сценариев опухолево-иммунной динамики, а также их трансформаций, вызываемых терапевтическими воздействиями. Выявлен механизм трансформации простых равновесных режимов взаимодействия опухолевых, иммунных и здоровых клеток в сложные осцилляторные спайковые и хаотические режимы при увеличении интенсивности терапии. Полученные результаты анализа данной модели будут полезны для лучшего понимания сложных процессов изменения опухоли на фоне химиотерапии. 9) Для четырёхмерной модификации модели Люо-Руди сердечной активности проведен детальный бифуркационный анализ, локализованы суб- и суперкритические бифуркации, а также бифуркация добавления спайков. Для стохастического варианта модели с мультипликативными шумами получено параметрическое описание феноменов, связанных с качественной деформацией потенциала действия. Дана математическая трактовка этих феноменов в терминах стохастических P- и D-бифуркаций и биологическая интерпретация возникновения ранних постдеполяризаций под действием шума. 10) Для системы двух связанных популяций, демонстрирующих в условиях изоляции периодические режимы, получено параметрическое описание возможных бифуркаций, возникающих при увеличении интенсивности взаимных перетоков. Локализованы параметрические зоны, отвечающие софазным и противофазным режимам совместной динамики с периодическими, квазипериодическими и хаотическими осцилляциями. Для случаев бистабильности построены бассейны притяжения сосуществующих аттракторов. Выявлена роль транзиентных аттракторов и фрактальных бассейнов в анализе вызванных шумами переходов между софазными и противофазными режимами, а также между порядком и хаосом. 11) Для четырехмерной эпидемиологической модели «жертва-хищник-топ хищник» с разделением популяции хищников в трофической цепочке на здоровых и инфицированных выявлены параметрические зоны равновесных, осцилляционных (регулярных и хаотических) режимов с зонами спайкинга и бёрстинга. Локализована параметрическая зона со смешанным характером динамики, где обнаружен хаотический бёрстинг с различным числом спайков в активной зоне. Построены параметрические диаграммы для вызванных случайными параметрическими возмущениями переходов между порядком и хаосом, найдена связь со стохастическими P- и D-бифуркациями. 12) Разработаны методы моделирования и анализа динамических систем с биологически мотивированными цветными шумами. Для модели Ли-Ринцеля получено параметрическое описание вызванного цветным шумом возбуждения спайковых кальциевых осцилляций при вариации интенсивности и времени корреляции. Выявлен эффект стохастических резонансов и локализованы их параметрические зоны. 13) Разработаны алгоритмы для исследования процессов самоорганизации для распределенных диффузионных моделей в случае двумерных пространственных областей. Для популяционной и гликолитической моделей описано разнообразие формируемых паттернов – аттракторов и переходных процессов в зоне тьюринговской неустойчивости, проанализирована степень мультистабильности и зависимость геометрии паттернов от соотношения диффузионных коэффициентов. 14) Разработан подход, позволяющий свести проблему предотвращения экологических сдвигов, вызываемых случайными возмущениями, к математической задаче синтеза аттракторов с наперед заданным пониженным значением стохастической чувствительности. Решены задачи управляемости и достижимости, а также построен алгоритм синтеза регулятора, стабилизирующего стохастическую популяционную модель с Олли эффектом и позволяющего избежать вызванного демографическим шумом вымирания популяции.

 

Публикации

1. Башкирцева И. Genesis of noise-induced multimodal chaotic oscillations in enzyme kinetics: Stochastic bifurcations and sensitivity analysis International Journal of Bifurcation and Chaos, v. 33, n. 6, p. 2330013 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1142/S0218127423300136

2. Башкирцева И., Панкратов А., Ряшко Л. Quantitative analysis of pattern formation in a multistable model of glycolysis with diffusion Physica D: Nonlinear Phenomena, v. 455, p. 133890 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1016/j.physd.2023.133890

3. Башкирцева И., Писарчик А.Н., Ряшко Л. Multistability and stochastic dynamics of Rulkov neurons coupled via a chemical synapse Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulation, v. 125, p. 107383 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1016/j.cnsns.2023.107383

4. Башкирцева И., Писарчик А.Н., Ряшко Л. Coexisting attractors and multistate noise-induced intermittency in a cycle ring of Rulkov neurons Mathematics, v. 11, n. 3, p. 597 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.3390/math11030597

5. Башкирцева И., Ряшко Л. Transformations of spike and burst oscillations in the stochastic Rulkov model Chaos, Solitons & Fractals, v. 170, p. 113414 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1016/j.chaos.2023.113414

6. Башкирцева И., Чухарева А., Ряшко Л. Stochastic dynamics of nonlinear tumor–immune system with chemotherapy Physica A, v. 622, p. 128835 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1016/j.physa.2023.128835

7. Колиниченко А., Башкирцева И., Ряшко Л. Self-organization in randomly forced diffusion systems: A stochastic sensitivity technique Mathematics, v. 11, n. 2, p. 451 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.3390/math11020451

8. Ряшко Л., Башкирцева И. Noise-induced structural transformations of oscillatory modes in calcium dynamics The European Physical Journal. Special Topics, v. 232, p. 1253–1259 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1140/epjs/s11734-023-00827-3

9. Ряшко Л., Беляев А., Башкирцева И. Noise-induced switching in dynamics of oscillating populations coupled by migration Chaos, v. 33, p. 063143 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1063/5.0153675

10. Ряшко Л., Перевалова Т., Башкирцева И. Stochastic bifurcations and multistage order–chaos transitions in a 4D eco-epidemiological model International Journal of Bifurcation and Chaos, v. 33, n. 09, p. 2350112 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1142/S0218127423501122

11. Слепухина Е., Башкирцева И., Кюглер П., Ряшко Л. Noise-driven bursting birhythmicity in the Hindmarsh–Rose neuron model Chaos, v. 33, n. 3, p.033106 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1063/5.0134561

12. Слепухина Е., Кюглер П., Башкирцева И., Ряшко Л. Noise-induced toroidal bursting oscillations and coherence resonance in the Morris-Lecar-Terman model International Journal of Bifurcation and Chaos, V. 33, N. 13, p. 2350159 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1142/S0218127423501596

13. Башкирцева Ирина Адольфовна, Беляев Александр Владимирович Стохастическая динамика модели метапопуляции Рикера -, 2023660713 (год публикации - )

14. Башкирцева Ирина Адольфовна, Панкратов Александр Андреевич Численное моделирование, статистический анализ и визуализация переходных процессов в системах дифференциальных уравнений с диффузией -, 2023660695 (год публикации - )

15. Колиниченко Александр Павлович, Ряшко Лев Борисович Метод функций стохастической чувствительности паттернов в математических моделях реакции-диффузии -, 2023663314 (год публикации - )


Возможность практического использования результатов
Полученные в проекте результаты имеют принципиальную значимость для существенного продвижения в понимании тонких механизмов поведения живых систем. Выявленные в ходе исследований новые стохастические явления в сложных биологических системах и разработанные в проекте конструктивные методы их анализа могут быть использованы при решении конкретных актуальных социально значимых задач, связанных с лечением опухолевых и сердечных заболеваний, когнитивных расстройств, прогнозированием эпидемий и предотвращением нежелательных экологических сдвигов. Важным приложением результатов проекта является их использование при разработке учебных курсов для подготовки кадров высшей квалификации, способных решать стоящие перед обществом современные научно-технические задачи.